More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3762 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 520 aa  1038    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  42.75 
 
 		 531 aa  360  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  47.37 
 
 		 351 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  46.51 
 
 		 355 aa  315  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  42.98 
 
 		 350 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  41.72 
 
 		 351 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  36.41 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  37.4 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  37.11 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  45.74 
 
 		 1207 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  43.4 
 
 		 1209 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  34.88 
 
 		 411 aa  189  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  43.36 
 
 		 426 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  39.57 
 
 		 435 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.05 
 
 		 431 aa  179  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  42.38 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  39.63 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  39.63 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  39.63 
 
 		 439 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  39.23 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  38.31 
 
 		 422 aa  159  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  38.94 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.38 
 
 		 1075 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  40.69 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  50.67 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  52.27 
 
 		 900 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  29.28 
 
 		 1207 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  31.66 
 
 		 380 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 1156 aa  136  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  30.03 
 
 		 561 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.46 
 
 		 1180 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 		 403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 		 1172 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  31.43 
 
 		 730 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  53.03 
 
 		 919 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48375  predicted protein  34.55 
 
 		 1169 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.91 
 
 		 695 aa  125  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 		 1133 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  28.52 
 
 		 1130 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48354  predicted protein  34.72 
 
 		 868 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.951648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2343  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  51.52 
 
 		 921 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.762005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49555  predicted protein  29.8 
 
 		 1198 aa  116  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50428  predicted protein  32.11 
 
 		 816 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47709  predicted protein  31.58 
 
 		 1196 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48678  predicted protein  31.94 
 
 		 806 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.9 
 
 		 584 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48350  predicted protein  34.57 
 
 		 1773 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0719027  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  28.62 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  31.83 
 
 		 421 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  39.6 
 
 		 285 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  30.49 
 
 		 1987 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  46.4 
 
 		 455 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  44.8 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38549  predicted protein  32.98 
 
 		 1128 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1391  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  27.3 
 
 		 1119 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.32 
 
 		 454 aa  108  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  45.6 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 204 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  45.76 
 
 		 462 aa  107  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  45.6 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.44 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  43.86 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  38.85 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50497  predicted protein  31.05 
 
 		 1165 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  35.03 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  44.8 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  44.8 
 
 		 457 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  44 
 
 		 457 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 562 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  44 
 
 		 457 aa  104  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 204 aa  104  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 		 421 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  44 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3878  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.67 
 
 		 892 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  26.36 
 
 		 348 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  43.2 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  43.2 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  27.4 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  46.55 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.74 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 		 331 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 312 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.22 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 312 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 312 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 		 237 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  41.23 
 
 		 571 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 564 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  40.29 
 
 		 228 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  41.23 
 
 		 571 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  37.09 
 
 		 170 aa  100  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 563 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>