More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3414 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
431 aa  880    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  39.67 
 
 
426 aa  289  9e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  50.41 
 
 
1209 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  48.07 
 
 
351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  48.31 
 
 
1207 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  45.18 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  45.45 
 
 
395 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  46.64 
 
 
381 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  48.61 
 
 
395 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  38.4 
 
 
443 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  41.05 
 
 
520 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  36.25 
 
 
439 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  36.84 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  35.86 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  35.86 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  42.74 
 
 
355 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  38.43 
 
 
407 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  34.47 
 
 
417 aa  169  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  43.2 
 
 
531 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  35.46 
 
 
422 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  40.18 
 
 
421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.22 
 
 
1075 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  31.36 
 
 
730 aa  124  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  35.89 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.95 
 
 
695 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 
351 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50497  predicted protein  34 
 
 
1165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49555  predicted protein  33.2 
 
 
1198 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47709  predicted protein  29.43 
 
 
1196 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48375  predicted protein  33.33 
 
 
1169 aa  109  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48354  predicted protein  35.64 
 
 
868 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.951648  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38549  predicted protein  29.47 
 
 
1128 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50428  predicted protein  33.17 
 
 
816 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48678  predicted protein  32.98 
 
 
806 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  35.14 
 
 
1987 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48350  predicted protein  31.02 
 
 
1773 aa  99  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0719027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1547  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.04 
 
 
758 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.592629  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43826  predicted protein  30.3 
 
 
1003 aa  90.1  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911661  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 
1093 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.96 
 
 
1081 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45310  predicted protein  32.47 
 
 
780 aa  83.6  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_4823  predicted protein  34.25 
 
 
145 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.121915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  31.11 
 
 
513 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  32.79 
 
 
518 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  30.57 
 
 
518 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  34.86 
 
 
607 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.7 
 
 
1080 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.09 
 
 
611 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  29.53 
 
 
515 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
717 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.22 
 
 
1226 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  26.29 
 
 
665 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3387  adenylate/guanylate cyclase  26.45 
 
 
781 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.61 
 
 
524 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.53 
 
 
648 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  31.37 
 
 
1160 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  31.03 
 
 
725 aa  73.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 
1198 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.73 
 
 
696 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 
861 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29 
 
 
860 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  28.3 
 
 
701 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2958  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000879483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.38 
 
 
703 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  32.62 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  28.71 
 
 
701 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  26.97 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  31.38 
 
 
911 aa  70.1  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  26.07 
 
 
536 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.88 
 
 
797 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  29.51 
 
 
643 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  29.12 
 
 
1204 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  32.21 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
320 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 
1153 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  29.9 
 
 
864 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
320 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0326  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.93 
 
 
628 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415974  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  29.81 
 
 
636 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.05 
 
 
637 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.11 
 
 
577 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 
561 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  27.73 
 
 
746 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  27.31 
 
 
740 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  28.24 
 
 
735 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.84 
 
 
1089 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  29.1 
 
 
1134 aa  67  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  29.15 
 
 
794 aa  67  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 
738 aa  67  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.38 
 
 
723 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 
641 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27 
 
 
678 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  26.85 
 
 
741 aa  66.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.04 
 
 
701 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
651 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 
702 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.57 
 
 
1055 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
859 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  28.65 
 
 
903 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>