More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0326 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0326  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  100 
 
 
628 aa  1189    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415974  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  48.43 
 
 
622 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  42.23 
 
 
618 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  42.86 
 
 
618 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  50.17 
 
 
613 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  26.97 
 
 
746 aa  178  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  26.25 
 
 
614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.64 
 
 
696 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.79 
 
 
737 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.71 
 
 
656 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  28.26 
 
 
670 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.8 
 
 
672 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.97 
 
 
658 aa  134  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.96 
 
 
754 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  28.04 
 
 
645 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.05 
 
 
611 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  22.82 
 
 
641 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.01 
 
 
758 aa  127  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  25.59 
 
 
741 aa  124  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  27.1 
 
 
696 aa  124  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  25.4 
 
 
701 aa  123  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  24.46 
 
 
607 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  29 
 
 
632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.97 
 
 
597 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  22.56 
 
 
758 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.44 
 
 
758 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  24.38 
 
 
744 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  40.43 
 
 
558 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  22.87 
 
 
643 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 
632 aa  110  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  26.95 
 
 
729 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  24.08 
 
 
721 aa  108  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  34.71 
 
 
469 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  26.46 
 
 
729 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  22.12 
 
 
758 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  25.71 
 
 
760 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  29.08 
 
 
650 aa  106  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.96 
 
 
723 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  21.8 
 
 
738 aa  105  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  23.93 
 
 
638 aa  104  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  26.06 
 
 
759 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.68 
 
 
764 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.52 
 
 
723 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  26.09 
 
 
665 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  24.66 
 
 
735 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  25.78 
 
 
731 aa  102  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  38.14 
 
 
572 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  37.11 
 
 
572 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  23.45 
 
 
794 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.57 
 
 
657 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  23.05 
 
 
582 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  37.84 
 
 
571 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  25.72 
 
 
756 aa  99  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  39.53 
 
 
468 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.42 
 
 
757 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  30.13 
 
 
358 aa  96.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  24.76 
 
 
645 aa  95.9  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.32 
 
 
825 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  26.22 
 
 
725 aa  95.5  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.55 
 
 
643 aa  95.5  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 
667 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.11 
 
 
701 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  36.81 
 
 
553 aa  94  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  26.74 
 
 
681 aa  94  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
777 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  29.63 
 
 
364 aa  92.8  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.28 
 
 
753 aa  92  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 
578 aa  92  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
464 aa  91.7  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.8 
 
 
1020 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  25.25 
 
 
675 aa  91.3  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.55 
 
 
637 aa  90.5  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.17 
 
 
656 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
777 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
643 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  36.71 
 
 
447 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  25.22 
 
 
734 aa  88.2  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 
561 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  29.41 
 
 
483 aa  87.4  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  28.99 
 
 
483 aa  86.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.44 
 
 
650 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 
284 aa  86.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  36.96 
 
 
547 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.71 
 
 
678 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
740 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  32.84 
 
 
518 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  32.23 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.04 
 
 
584 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  32.79 
 
 
564 aa  84.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  27.57 
 
 
701 aa  84.7  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.6 
 
 
584 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  32.84 
 
 
518 aa  84  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  29.87 
 
 
699 aa  83.6  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  27.1 
 
 
701 aa  83.2  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.91 
 
 
1080 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.61 
 
 
652 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  30.81 
 
 
513 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  35.94 
 
 
575 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 
515 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  36.45 
 
 
431 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>