More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0108 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  100 
 
 
648 aa  1296    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  31.09 
 
 
702 aa  250  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  30.64 
 
 
701 aa  226  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  30.57 
 
 
701 aa  224  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  31.44 
 
 
712 aa  216  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
651 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 
724 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 
726 aa  207  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.13 
 
 
637 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 
643 aa  193  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  36.79 
 
 
758 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  30.18 
 
 
713 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.67 
 
 
696 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  32.13 
 
 
636 aa  154  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  36.79 
 
 
701 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  39.42 
 
 
670 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  36.49 
 
 
696 aa  151  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.28 
 
 
936 aa  147  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.38 
 
 
737 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  38.66 
 
 
614 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  34.86 
 
 
746 aa  144  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  35.38 
 
 
734 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  35.43 
 
 
681 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 
675 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  35.45 
 
 
794 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.11 
 
 
694 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  37.81 
 
 
584 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.26 
 
 
672 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  33.49 
 
 
752 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.8 
 
 
656 aa  137  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  30.56 
 
 
758 aa  136  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  30 
 
 
758 aa  136  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  32.17 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  35.45 
 
 
584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  38.83 
 
 
729 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  38.12 
 
 
699 aa  135  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  39.68 
 
 
645 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  32.17 
 
 
441 aa  134  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.68 
 
 
701 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.36 
 
 
864 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  37.74 
 
 
756 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.74 
 
 
611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.07 
 
 
764 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38 
 
 
643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  30.26 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  34.47 
 
 
731 aa  131  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  32.92 
 
 
523 aa  131  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  36.51 
 
 
667 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  34.6 
 
 
717 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  38.71 
 
 
760 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.26 
 
 
753 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 
911 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  35.23 
 
 
638 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
859 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.97 
 
 
658 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  38.07 
 
 
759 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.22 
 
 
761 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
744 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  31.02 
 
 
860 aa  127  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  39.77 
 
 
607 aa  127  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
861 aa  127  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 
858 aa  127  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  34.08 
 
 
741 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  33.55 
 
 
593 aa  125  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.46 
 
 
758 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.64 
 
 
656 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  32.08 
 
 
729 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  33.8 
 
 
513 aa  124  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  29.18 
 
 
483 aa  124  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  29.63 
 
 
483 aa  124  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.78 
 
 
797 aa  123  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  38.54 
 
 
903 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
1156 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.53 
 
 
723 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  37.56 
 
 
635 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  29.65 
 
 
641 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.13 
 
 
657 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
1180 aa  120  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.7 
 
 
665 aa  120  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  35.35 
 
 
725 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
524 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.81 
 
 
703 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
526 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
479 aa  117  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.38 
 
 
757 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
632 aa  117  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 
364 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.52 
 
 
723 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  34.54 
 
 
738 aa  117  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.72 
 
 
744 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.91 
 
 
500 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.85 
 
 
678 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 
643 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  31.08 
 
 
487 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 
735 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  36.36 
 
 
971 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
1172 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  37.57 
 
 
518 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 
421 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  34.27 
 
 
546 aa  113  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>