More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0672 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  978    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.18 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.63 
 
 		 585 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  32.26 
 
 		 636 aa  166  8e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  31.53 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.53 
 
 		 696 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  32.62 
 
 		 696 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  33.55 
 
 		 593 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  37.79 
 
 		 746 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 		 744 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 		 738 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  37.02 
 
 		 479 aa  144  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  37.13 
 
 		 741 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  34.1 
 
 		 735 aa  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  36.94 
 
 		 614 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.25 
 
 		 701 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.05 
 
 		 737 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.07 
 
 		 757 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.29 
 
 		 657 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  32.89 
 
 		 546 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  38.33 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  39.45 
 
 		 670 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.12 
 
 		 656 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  36.19 
 
 		 446 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 758 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  35.48 
 
 		 911 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 		 1207 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  35.77 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  34.9 
 
 		 524 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  32.57 
 
 		 860 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.75 
 
 		 858 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  36.16 
 
 		 665 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  40.85 
 
 		 702 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 		 859 aa  136  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.21 
 
 		 656 aa  136  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  30.69 
 
 		 701 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  36.71 
 
 		 518 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  36.04 
 
 		 794 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.11 
 
 		 500 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  31.05 
 
 		 701 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 		 701 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 		 861 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  30.8 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  40.45 
 
 		 526 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.43 
 
 		 658 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  37.28 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  27.27 
 
 		 483 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  30 
 
 		 431 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 		 864 aa  133  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  30.53 
 
 		 441 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  27.5 
 
 		 483 aa  133  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.28 
 
 		 672 aa  133  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 734 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  35.32 
 
 		 529 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  35.47 
 
 		 532 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  41.51 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.46 
 
 		 524 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  29.01 
 
 		 713 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  35.59 
 
 		 518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  35.18 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.77 
 
 		 936 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01760  family 3 adenylate cyclase  33.68 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 		 903 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  31.76 
 
 		 513 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  34.23 
 
 		 515 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.19 
 
 		 678 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  35.35 
 
 		 460 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  34.78 
 
 		 717 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  34.14 
 
 		 526 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  36.42 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.3 
 
 		 611 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 		 712 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 		 752 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.79 
 
 		 528 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  35.05 
 
 		 1093 aa  124  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  32.57 
 
 		 758 aa  124  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.14 
 
 		 694 aa  123  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  32.57 
 
 		 758 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 		 1153 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 		 546 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  34.38 
 
 		 684 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  34.69 
 
 		 744 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  33.87 
 
 		 675 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  31.56 
 
 		 536 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.58 
 
 		 662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  34.47 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  36.57 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.95 
 
 		 577 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.56 
 
 		 1020 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.05 
 
 		 637 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.91 
 
 		 588 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.19 
 
 		 703 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  31.36 
 
 		 729 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  32.56 
 
 		 643 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 		 662 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  36.46 
 
 		 582 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  30.42 
 
 		 641 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  37.14 
 
 		 650 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  35.59 
 
 		 641 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>