More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1763 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  74.51 
 
 		 723 aa  1071    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  74.79 
 
 		 723 aa  1077    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  100 
 
 		 725 aa  1446    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  47.81 
 
 		 764 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  46.12 
 
 		 756 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  47.03 
 
 		 753 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  50 
 
 		 759 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  49.33 
 
 		 760 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  40.76 
 
 		 729 aa  422  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  38.24 
 
 		 744 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  37.95 
 
 		 731 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.4 
 
 		 754 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  36.76 
 
 		 729 aa  369  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  32.44 
 
 		 721 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 		 734 aa  287  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.25 
 
 		 696 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.07 
 
 		 737 aa  282  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  33.69 
 
 		 670 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 		 741 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.49 
 
 		 758 aa  273  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 		 746 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 		 738 aa  254  5.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.59 
 
 		 656 aa  248  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.27 
 
 		 658 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  29.88 
 
 		 753 aa  238  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  27.38 
 
 		 758 aa  235  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31 
 
 		 672 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  27.7 
 
 		 758 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.24 
 
 		 643 aa  229  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 		 758 aa  229  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 		 701 aa  227  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  29.67 
 
 		 794 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.35 
 
 		 657 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  25.68 
 
 		 641 aa  209  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  32.7 
 
 		 645 aa  200  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.16 
 
 		 614 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 		 752 aa  194  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  29.09 
 
 		 667 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.62 
 
 		 694 aa  190  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  41.52 
 
 		 650 aa  189  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.1 
 
 		 656 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  31.4 
 
 		 717 aa  174  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.13 
 
 		 936 aa  174  7.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  25.88 
 
 		 696 aa  173  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2084  putative Chase2 sensor protein  35.85 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.478351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  26.94 
 
 		 665 aa  172  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.86 
 
 		 761 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.52 
 
 		 652 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  26.63 
 
 		 607 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  30.81 
 
 		 708 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  34.88 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.22 
 
 		 701 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.98 
 
 		 597 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  31.66 
 
 		 675 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.68 
 
 		 735 aa  155  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  36.36 
 
 		 483 aa  153  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  35.91 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  27.62 
 
 		 635 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  40.18 
 
 		 699 aa  150  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  25.28 
 
 		 638 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 		 284 aa  148  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.16 
 
 		 757 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.71 
 
 		 703 aa  147  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  35.98 
 
 		 702 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.91 
 
 		 858 aa  144  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  34.06 
 
 		 681 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.43 
 
 		 701 aa  142  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  37.22 
 
 		 636 aa  141  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  26.92 
 
 		 632 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  33.96 
 
 		 701 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  34.08 
 
 		 641 aa  140  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.16 
 
 		 678 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 		 864 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  28.32 
 
 		 744 aa  137  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 		 859 aa  137  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.1 
 
 		 611 aa  136  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  36.74 
 
 		 726 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  35.51 
 
 		 724 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.29 
 
 		 861 aa  134  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  30.61 
 
 		 860 aa  134  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  28.13 
 
 		 645 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 		 911 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  34.37 
 
 		 671 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 593 aa  130  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.79 
 
 		 1207 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  35.02 
 
 		 713 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  41.12 
 
 		 585 aa  127  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  32.17 
 
 		 441 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  34.95 
 
 		 712 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  31.3 
 
 		 431 aa  124  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  39.29 
 
 		 651 aa  123  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  27.37 
 
 		 643 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  25.91 
 
 		 582 aa  122  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 643 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 		 654 aa  120  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  36.55 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  32.77 
 
 		 740 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.92 
 
 		 637 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.88 
 
 		 648 aa  118  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 		 536 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>