More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3621 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 607 aa  1243    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.75 
 
 		 696 aa  249  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  29.64 
 
 		 701 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  30.55 
 
 		 729 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  30.77 
 
 		 670 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.62 
 
 		 611 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  29.66 
 
 		 645 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.25 
 
 		 641 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  29.25 
 
 		 746 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.33 
 
 		 758 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  26.91 
 
 		 731 aa  217  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  29.31 
 
 		 614 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  27.29 
 
 		 744 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  29.33 
 
 		 734 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  28.73 
 
 		 758 aa  212  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.22 
 
 		 656 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  29.22 
 
 		 667 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  28.1 
 
 		 758 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.24 
 
 		 658 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  28.06 
 
 		 741 aa  206  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.32 
 
 		 656 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.08 
 
 		 672 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.35 
 
 		 657 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  26.47 
 
 		 738 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.94 
 
 		 737 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.02 
 
 		 758 aa  197  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  27.15 
 
 		 794 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  30.59 
 
 		 638 aa  194  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  28.45 
 
 		 650 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.57 
 
 		 694 aa  191  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.33 
 
 		 764 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  26.72 
 
 		 729 aa  190  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.67 
 
 		 754 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  25.79 
 
 		 759 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.74 
 
 		 597 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 		 696 aa  180  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  26.63 
 
 		 725 aa  177  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 		 752 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  25.63 
 
 		 760 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  41.89 
 
 		 284 aa  174  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  25.97 
 
 		 721 aa  173  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  26.74 
 
 		 675 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  26.53 
 
 		 665 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  25.08 
 
 		 756 aa  170  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  28.86 
 
 		 582 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.24 
 
 		 652 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.84 
 
 		 701 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.83 
 
 		 723 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  42.06 
 
 		 515 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  41.28 
 
 		 864 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  42.34 
 
 		 518 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  30.13 
 
 		 632 aa  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  41.83 
 
 		 701 aa  163  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.87 
 
 		 753 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  41.44 
 
 		 518 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.27 
 
 		 723 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  41.28 
 
 		 911 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 		 735 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  40.87 
 
 		 701 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.89 
 
 		 637 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  41.82 
 
 		 859 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.52 
 
 		 703 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  41.38 
 
 		 860 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.4 
 
 		 936 aa  156  8e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  27.69 
 
 		 641 aa  156  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  39.9 
 
 		 861 aa  156  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.4 
 
 		 643 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  39.59 
 
 		 797 aa  155  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 		 643 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  40.91 
 
 		 858 aa  154  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  26.41 
 
 		 645 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  40.18 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  40.28 
 
 		 903 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  28.33 
 
 		 717 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  35.45 
 
 		 702 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  37.38 
 
 		 651 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  32.37 
 
 		 699 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  34.47 
 
 		 513 aa  147  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  37.55 
 
 		 593 aa  147  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  39.62 
 
 		 523 aa  146  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  38.91 
 
 		 636 aa  146  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  46.51 
 
 		 439 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 		 744 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  35.78 
 
 		 483 aa  144  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  35.32 
 
 		 483 aa  144  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.55 
 
 		 585 aa  144  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  38.81 
 
 		 681 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  40.1 
 
 		 546 aa  140  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.72 
 
 		 757 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  26.74 
 
 		 632 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  23.47 
 
 		 643 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  34.84 
 
 		 441 aa  137  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  35.74 
 
 		 431 aa  137  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2916  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.65 
 
 		 575 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0753379  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.95 
 
 		 761 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.38 
 
 		 440 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  37.38 
 
 		 971 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.71 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  41.85 
 
 		 1160 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  37.85 
 
 		 1020 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>