More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0671 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 593 aa  1201    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  38.44 
 
 		 696 aa  226  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  39.33 
 
 		 758 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  41.12 
 
 		 903 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  36.41 
 
 		 758 aa  213  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  36.13 
 
 		 758 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  41.55 
 
 		 717 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  38.31 
 
 		 794 aa  204  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.17 
 
 		 797 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.79 
 
 		 737 aa  197  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  35.69 
 
 		 734 aa  197  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.63 
 
 		 696 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  37.04 
 
 		 636 aa  194  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  37.41 
 
 		 701 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  36.91 
 
 		 746 aa  193  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  34.65 
 
 		 859 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.84 
 
 		 858 aa  192  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  36.42 
 
 		 741 aa  191  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 		 702 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.83 
 
 		 701 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 		 724 aa  186  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.31 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  35.52 
 
 		 701 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  33.54 
 
 		 726 aa  181  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.81 
 
 		 936 aa  177  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  41.38 
 
 		 752 aa  173  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 864 aa  173  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.24 
 
 		 754 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 		 861 aa  166  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  35.28 
 
 		 713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  33.98 
 
 		 744 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 		 712 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 860 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.95 
 
 		 703 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  31.51 
 
 		 911 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.92 
 
 		 694 aa  158  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.07 
 
 		 758 aa  158  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  39.91 
 
 		 670 aa  154  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  32.42 
 
 		 487 aa  151  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.03 
 
 		 761 aa  150  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  36.56 
 
 		 760 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.66 
 
 		 656 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  32.23 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  32.65 
 
 		 483 aa  147  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  37.55 
 
 		 607 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  33.02 
 
 		 731 aa  144  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.86 
 
 		 764 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  39.13 
 
 		 729 aa  143  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 		 667 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.21 
 
 		 657 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  37.82 
 
 		 665 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  37.14 
 
 		 756 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.74 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 		 645 aa  139  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  38.2 
 
 		 650 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 		 643 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.39 
 
 		 753 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 759 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  36.55 
 
 		 729 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.5 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.41 
 
 		 637 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  29.18 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.23 
 
 		 652 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.98 
 
 		 585 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  33.6 
 
 		 479 aa  134  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.65 
 
 		 658 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.61 
 
 		 611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 		 738 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  36.36 
 
 		 725 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.83 
 
 		 744 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 		 675 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.04 
 
 		 757 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 651 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.12 
 
 		 672 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  35.93 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  31.02 
 
 		 358 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  36.49 
 
 		 528 aa  127  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.67 
 
 		 656 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  32.27 
 
 		 482 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  29.96 
 
 		 1805 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  32.44 
 
 		 641 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 		 681 aa  125  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  26.51 
 
 		 364 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.36 
 
 		 648 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  34.63 
 
 		 515 aa  123  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.83 
 
 		 678 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.7 
 
 		 735 aa  123  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  33.76 
 
 		 465 aa  123  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  33.76 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  32.89 
 
 		 614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  27.73 
 
 		 1130 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  27.54 
 
 		 1119 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 		 1207 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  34.32 
 
 		 518 aa  122  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  37.31 
 
 		 1093 aa  121  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  32.29 
 
 		 753 aa  120  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  27.73 
 
 		 1133 aa  120  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 		 738 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.94 
 
 		 465 aa  120  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>