More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3665 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 439 aa  877    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  78.41 
 
 		 440 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  57.01 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  43.46 
 
 		 903 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  46.51 
 
 		 607 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  32.18 
 
 		 614 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 638 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  36.36 
 
 		 701 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  36.36 
 
 		 701 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  33.8 
 
 		 734 aa  143  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.1 
 
 		 701 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  41.9 
 
 		 549 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  38.16 
 
 		 483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  37.68 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.21 
 
 		 758 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  42.65 
 
 		 532 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  42.65 
 
 		 536 aa  136  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.45 
 
 		 611 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  40.19 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.25 
 
 		 737 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  38.39 
 
 		 643 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  31.19 
 
 		 641 aa  133  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  38.6 
 
 		 702 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.1 
 
 		 656 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 		 735 aa  133  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  35.52 
 
 		 741 aa  132  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.05 
 
 		 696 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  45.51 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.21 
 
 		 637 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  45.51 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  45.51 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  31.32 
 
 		 744 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  37.09 
 
 		 441 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  36.15 
 
 		 431 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  35.65 
 
 		 284 aa  129  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  38.55 
 
 		 911 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  36.65 
 
 		 744 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  35.43 
 
 		 483 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.5 
 
 		 585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  39.67 
 
 		 636 aa  128  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  35.78 
 
 		 758 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  37.44 
 
 		 729 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  42.73 
 
 		 524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.17 
 
 		 500 aa  127  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  36.41 
 
 		 759 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 760 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  39.73 
 
 		 514 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  35.78 
 
 		 758 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3875  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  44.83 
 
 		 499 aa  126  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.51 
 
 		 657 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.75 
 
 		 764 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  38.28 
 
 		 421 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  35.25 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  37.98 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  40.86 
 
 		 650 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.11 
 
 		 757 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  39.19 
 
 		 971 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  37.31 
 
 		 717 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.74 
 
 		 652 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 		 758 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  29.96 
 
 		 643 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.38 
 
 		 703 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  38.1 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.56 
 
 		 864 aa  123  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  39.01 
 
 		 591 aa  123  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  35.94 
 
 		 632 aa  122  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  40.96 
 
 		 571 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  42.94 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  39.08 
 
 		 667 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 		 488 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31.95 
 
 		 694 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.48 
 
 		 529 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 		 696 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.72 
 
 		 1207 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  36.56 
 
 		 746 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  36.97 
 
 		 699 aa  120  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11345  adenylate cyclase  35.75 
 
 		 541 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  43.42 
 
 		 564 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  38.14 
 
 		 645 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.92 
 
 		 643 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.56 
 
 		 861 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  36.94 
 
 		 540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  34.93 
 
 		 546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  38.53 
 
 		 969 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  36.94 
 
 		 540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  36.94 
 
 		 540 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  39.02 
 
 		 582 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  41.29 
 
 		 572 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  39.66 
 
 		 645 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  39.69 
 
 		 651 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  36.61 
 
 		 536 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.18 
 
 		 672 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0577  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.32 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  35.36 
 
 		 859 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  33.02 
 
 		 756 aa  117  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 593 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  37.99 
 
 		 670 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.16 
 
 		 754 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.82 
 
 		 656 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>