More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0721 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
729 aa  1468    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  42.19 
 
 
721 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  37.46 
 
 
759 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.46 
 
 
764 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.61 
 
 
753 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  35.97 
 
 
760 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  36.88 
 
 
756 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.54 
 
 
723 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.24 
 
 
723 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  36.76 
 
 
725 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  38.41 
 
 
729 aa  359  9e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.76 
 
 
754 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  34.06 
 
 
744 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  32.07 
 
 
731 aa  307  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.64 
 
 
758 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  29.68 
 
 
746 aa  274  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  32.97 
 
 
670 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.78 
 
 
737 aa  265  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 
741 aa  262  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.21 
 
 
643 aa  261  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.93 
 
 
696 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  28.1 
 
 
738 aa  251  3e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.46 
 
 
658 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.13 
 
 
758 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 
752 aa  225  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  25.11 
 
 
758 aa  223  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  25.5 
 
 
758 aa  220  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  26.53 
 
 
734 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  26.85 
 
 
701 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  27.9 
 
 
753 aa  218  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28 
 
 
656 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  26.54 
 
 
794 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.04 
 
 
672 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  45.33 
 
 
421 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  26.59 
 
 
641 aa  211  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  29.27 
 
 
665 aa  207  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  27.74 
 
 
667 aa  204  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  43.79 
 
 
447 aa  203  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.03 
 
 
694 aa  201  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  29.25 
 
 
645 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  46.3 
 
 
421 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  27.83 
 
 
614 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  26.85 
 
 
607 aa  191  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2084  putative Chase2 sensor protein  34.77 
 
 
499 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.478351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  36.1 
 
 
499 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  26.03 
 
 
696 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  28.47 
 
 
635 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.77 
 
 
757 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.76 
 
 
936 aa  169  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 
675 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.93 
 
 
678 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  27.87 
 
 
735 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.04 
 
 
761 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.98 
 
 
657 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  27.06 
 
 
643 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  31.08 
 
 
708 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.78 
 
 
611 aa  156  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 
681 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.42 
 
 
638 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  33.53 
 
 
671 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  35.79 
 
 
699 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  30.71 
 
 
701 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  31.09 
 
 
701 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  26.57 
 
 
650 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1897  metal-dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 
671 aa  144  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  26.63 
 
 
717 aa  144  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.27 
 
 
652 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 
864 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.82 
 
 
701 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  22.34 
 
 
744 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  35.89 
 
 
593 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  25.82 
 
 
632 aa  139  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  30.41 
 
 
632 aa  135  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  28.42 
 
 
859 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  36.27 
 
 
651 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.45 
 
 
656 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  24.02 
 
 
582 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 
654 aa  134  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  29.56 
 
 
702 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 
713 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1407  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
691 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.98 
 
 
284 aa  131  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.25 
 
 
597 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.58 
 
 
858 aa  130  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  30.91 
 
 
726 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.3 
 
 
860 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  30.61 
 
 
911 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.57 
 
 
703 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  30.55 
 
 
641 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  36.65 
 
 
513 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.3 
 
 
861 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.08 
 
 
648 aa  124  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  31.1 
 
 
712 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.57 
 
 
650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.7 
 
 
622 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  30.93 
 
 
487 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  36.92 
 
 
536 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 
903 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  32.62 
 
 
441 aa  118  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  28.64 
 
 
645 aa  118  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>