More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1553 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  54.2 
 
 
744 aa  784    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  100 
 
 
754 aa  1485    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  43.11 
 
 
729 aa  479  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  41.45 
 
 
764 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  40.46 
 
 
756 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.56 
 
 
753 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  40.72 
 
 
760 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  40.6 
 
 
759 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.59 
 
 
723 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  37.58 
 
 
725 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.52 
 
 
723 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  34.04 
 
 
746 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  37.52 
 
 
734 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.64 
 
 
758 aa  363  9e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 
729 aa  360  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 
721 aa  354  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  35.36 
 
 
731 aa  353  5e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  34.17 
 
 
741 aa  349  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.07 
 
 
696 aa  341  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  38.96 
 
 
670 aa  339  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.04 
 
 
737 aa  335  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  30.5 
 
 
758 aa  324  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  31.53 
 
 
738 aa  321  3e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  30.67 
 
 
758 aa  316  8e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  37.44 
 
 
650 aa  311  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  31.56 
 
 
753 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.7 
 
 
657 aa  308  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.8 
 
 
656 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.47 
 
 
758 aa  290  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 
794 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  30.32 
 
 
696 aa  270  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.79 
 
 
658 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.75 
 
 
672 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.99 
 
 
656 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  31.52 
 
 
752 aa  244  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.05 
 
 
694 aa  242  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 
667 aa  227  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  26.52 
 
 
641 aa  221  5e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  29.98 
 
 
614 aa  218  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
645 aa  218  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  26.93 
 
 
701 aa  213  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.45 
 
 
643 aa  213  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  40.32 
 
 
903 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  35.39 
 
 
864 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  28.95 
 
 
638 aa  196  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  37.2 
 
 
702 aa  192  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 
607 aa  190  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  34.32 
 
 
859 aa  188  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.42 
 
 
701 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 
665 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.07 
 
 
936 aa  186  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.47 
 
 
701 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  34.87 
 
 
499 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  34.59 
 
 
701 aa  184  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.92 
 
 
761 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  38.24 
 
 
593 aa  182  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.04 
 
 
611 aa  181  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.85 
 
 
858 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  38.94 
 
 
717 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.97 
 
 
652 aa  178  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.9 
 
 
703 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2084  putative Chase2 sensor protein  35.01 
 
 
499 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.478351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  25.45 
 
 
582 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  35.64 
 
 
726 aa  170  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  31.12 
 
 
708 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 
724 aa  167  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.68 
 
 
861 aa  167  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
744 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  31.91 
 
 
860 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  35.08 
 
 
671 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 
911 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 
735 aa  158  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.15 
 
 
757 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  32.78 
 
 
654 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  25.82 
 
 
632 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1897  metal-dependent phosphohydrolase  34.93 
 
 
671 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  26.91 
 
 
635 aa  151  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.23 
 
 
597 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  37.83 
 
 
636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 
632 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  40.79 
 
 
441 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  39.91 
 
 
431 aa  145  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  32.12 
 
 
712 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  35.53 
 
 
713 aa  144  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
641 aa  143  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  35.71 
 
 
483 aa  141  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  35.71 
 
 
483 aa  141  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 
1207 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.55 
 
 
650 aa  140  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31.25 
 
 
797 aa  138  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  40.25 
 
 
585 aa  135  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  30.44 
 
 
699 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  31.45 
 
 
463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  29.54 
 
 
675 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 
462 aa  130  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.48 
 
 
678 aa  131  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
483 aa  130  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  32.18 
 
 
446 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  31.55 
 
 
740 aa  129  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  32.35 
 
 
465 aa  129  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>