More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1993 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  100 
 
 
708 aa  1417    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  35.22 
 
 
671 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  37.18 
 
 
499 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 
744 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2084  putative Chase2 sensor protein  31.8 
 
 
499 aa  197  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.478351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.35 
 
 
486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.55 
 
 
723 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  32.06 
 
 
760 aa  180  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 
759 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.23 
 
 
723 aa  178  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  30.5 
 
 
725 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.53 
 
 
753 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
729 aa  174  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  35.14 
 
 
721 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  37.4 
 
 
705 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  37.4 
 
 
644 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  40.24 
 
 
716 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.4 
 
 
764 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  41.8 
 
 
535 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 
756 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.05 
 
 
754 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  34.06 
 
 
648 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.02 
 
 
678 aa  165  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
660 aa  163  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  34.83 
 
 
729 aa  160  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 
705 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  38.67 
 
 
543 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  35.25 
 
 
683 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  37.73 
 
 
708 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  35.83 
 
 
706 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  32.73 
 
 
379 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  35.41 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  34.51 
 
 
657 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  37.31 
 
 
723 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  35.69 
 
 
643 aa  148  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  37.35 
 
 
649 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  34.12 
 
 
631 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 
451 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
731 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  34.64 
 
 
645 aa  144  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  34.46 
 
 
634 aa  138  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  36.23 
 
 
453 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  32.82 
 
 
451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  33.74 
 
 
472 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  33.21 
 
 
566 aa  135  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  34.48 
 
 
687 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.45 
 
 
758 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  31.97 
 
 
413 aa  129  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.77 
 
 
741 aa  127  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.63 
 
 
572 aa  126  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.63 
 
 
590 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  36.68 
 
 
366 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  29.02 
 
 
340 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  29.84 
 
 
670 aa  122  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.24 
 
 
389 aa  121  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  32.26 
 
 
1087 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.56 
 
 
1004 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.4 
 
 
995 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  33.06 
 
 
1100 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.96 
 
 
563 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  32.26 
 
 
1087 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  32.42 
 
 
378 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.98 
 
 
1480 aa  117  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  31.92 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  27.58 
 
 
738 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  32.93 
 
 
643 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  28.16 
 
 
753 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.97 
 
 
997 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.92 
 
 
957 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.95 
 
 
1017 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.66 
 
 
737 aa  114  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  33.83 
 
 
365 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.11 
 
 
507 aa  114  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  29.62 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  33.07 
 
 
364 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  34.66 
 
 
381 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.6 
 
 
1332 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  30.63 
 
 
630 aa  111  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.85 
 
 
385 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  32.69 
 
 
429 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  31.58 
 
 
438 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  29.41 
 
 
445 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  34.29 
 
 
846 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1407  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
691 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  29.54 
 
 
404 aa  110  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  34.13 
 
 
443 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 
734 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  31.94 
 
 
649 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
654 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.86 
 
 
516 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
361 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  29.97 
 
 
1079 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.59 
 
 
961 aa  108  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  33.85 
 
 
467 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.46 
 
 
748 aa  107  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  29.87 
 
 
445 aa  107  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  32.54 
 
 
376 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.28 
 
 
480 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  29.18 
 
 
459 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31 
 
 
393 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>