More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2371 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  100 
 
 
657 aa  1321    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  60.13 
 
 
650 aa  700    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  88.89 
 
 
656 aa  1133    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 
744 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.2 
 
 
754 aa  306  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.38 
 
 
696 aa  279  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.93 
 
 
764 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  33.78 
 
 
760 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  32.4 
 
 
756 aa  266  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  33.08 
 
 
759 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.74 
 
 
753 aa  256  9e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  29.77 
 
 
701 aa  247  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  34.23 
 
 
670 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  33.05 
 
 
614 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  34.9 
 
 
752 aa  234  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.49 
 
 
694 aa  233  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 
734 aa  231  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  29.09 
 
 
696 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  34.52 
 
 
746 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  42.75 
 
 
729 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.33 
 
 
723 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 
794 aa  217  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.55 
 
 
638 aa  216  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  30.56 
 
 
725 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.72 
 
 
656 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.39 
 
 
723 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.01 
 
 
737 aa  210  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.97 
 
 
758 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 
731 aa  201  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.88 
 
 
701 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 
758 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.82 
 
 
703 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.24 
 
 
741 aa  193  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  28.4 
 
 
607 aa  193  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  28.04 
 
 
667 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  27.95 
 
 
645 aa  191  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  41.04 
 
 
672 aa  190  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  33.26 
 
 
758 aa  187  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  33.49 
 
 
758 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  36.99 
 
 
717 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  38.72 
 
 
702 aa  186  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.64 
 
 
936 aa  183  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.52 
 
 
611 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  28.71 
 
 
632 aa  181  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  30.96 
 
 
641 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.93 
 
 
597 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.27 
 
 
658 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.53 
 
 
650 aa  177  7e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  34.13 
 
 
675 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  29.97 
 
 
744 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
861 aa  172  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  25.95 
 
 
721 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  27.64 
 
 
735 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  30.24 
 
 
665 aa  171  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 
712 aa  170  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 
738 aa  170  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.9 
 
 
701 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
860 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  34.2 
 
 
864 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  34.51 
 
 
701 aa  165  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.3 
 
 
757 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.54 
 
 
761 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  38.73 
 
 
903 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  39.04 
 
 
699 aa  164  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  26.33 
 
 
641 aa  163  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 
729 aa  161  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  27.34 
 
 
582 aa  160  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  28.77 
 
 
681 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  25.04 
 
 
643 aa  154  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 
724 aa  154  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  36.28 
 
 
911 aa  153  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  34.76 
 
 
859 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  34.98 
 
 
636 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  33.63 
 
 
726 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  37 
 
 
1207 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  29.57 
 
 
632 aa  147  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.57 
 
 
643 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.53 
 
 
637 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.06 
 
 
797 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 
713 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 
858 aa  145  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  31.56 
 
 
753 aa  145  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  33.21 
 
 
593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  31.94 
 
 
463 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  36.29 
 
 
487 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  36.55 
 
 
446 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  34.63 
 
 
513 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  30.94 
 
 
465 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 
536 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  35.24 
 
 
483 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.15 
 
 
652 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.04 
 
 
284 aa  137  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  37.23 
 
 
441 aa  137  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  36.36 
 
 
431 aa  137  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 
643 aa  137  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  32.07 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  31.75 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.2 
 
 
577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  31.65 
 
 
483 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  35.92 
 
 
421 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>