More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0411 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  100 
 
 
694 aa  1414    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  37.94 
 
 
752 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 
701 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.02 
 
 
696 aa  303  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 
758 aa  297  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  29.13 
 
 
746 aa  276  8e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 
696 aa  266  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  28.71 
 
 
794 aa  259  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  30.45 
 
 
744 aa  259  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  29.66 
 
 
741 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
645 aa  252  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  31.17 
 
 
670 aa  248  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.46 
 
 
656 aa  246  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.67 
 
 
656 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.09 
 
 
658 aa  243  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.31 
 
 
657 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  27.36 
 
 
734 aa  240  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.24 
 
 
936 aa  239  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.39 
 
 
672 aa  237  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.1 
 
 
754 aa  235  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.76 
 
 
764 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.53 
 
 
737 aa  226  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.17 
 
 
701 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  29.21 
 
 
729 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  28.59 
 
 
760 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.66 
 
 
761 aa  220  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  27.29 
 
 
667 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  27.89 
 
 
614 aa  216  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.45 
 
 
703 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 
759 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.1 
 
 
753 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 
756 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  24.9 
 
 
758 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 
738 aa  207  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  36.27 
 
 
702 aa  207  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.7 
 
 
758 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  27.88 
 
 
729 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  25 
 
 
758 aa  206  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.36 
 
 
723 aa  206  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.73 
 
 
723 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  26.3 
 
 
721 aa  203  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  29.11 
 
 
607 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  27.5 
 
 
717 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  29.62 
 
 
725 aa  197  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  36.6 
 
 
650 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.35 
 
 
638 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  36.62 
 
 
701 aa  194  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  26.12 
 
 
731 aa  193  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  36.97 
 
 
701 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  27.41 
 
 
641 aa  192  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  33.41 
 
 
713 aa  187  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.03 
 
 
597 aa  183  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  28.38 
 
 
675 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 
665 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
681 aa  173  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  32.37 
 
 
712 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  27.44 
 
 
632 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.76 
 
 
611 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  37.32 
 
 
699 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  33.44 
 
 
864 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  28.84 
 
 
582 aa  164  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 
903 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.67 
 
 
643 aa  161  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  32.92 
 
 
593 aa  159  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 
858 aa  159  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 
911 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  27.16 
 
 
635 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.44 
 
 
652 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  31.21 
 
 
726 aa  154  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  30.03 
 
 
859 aa  154  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
861 aa  152  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.45 
 
 
860 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.4 
 
 
585 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.38 
 
 
797 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  36.52 
 
 
479 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  28.16 
 
 
735 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  33.02 
 
 
446 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  33.33 
 
 
463 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  34.3 
 
 
526 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  38.53 
 
 
483 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  31.04 
 
 
632 aa  144  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  34.84 
 
 
636 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  37 
 
 
465 aa  143  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  36.23 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  32.99 
 
 
462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  33.9 
 
 
724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.6 
 
 
662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 
744 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.11 
 
 
648 aa  142  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  39.2 
 
 
524 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  38.1 
 
 
651 aa  141  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  32.86 
 
 
532 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.24 
 
 
650 aa  140  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  43.35 
 
 
738 aa  140  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  39.2 
 
 
526 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  39.17 
 
 
684 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  40.8 
 
 
662 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  36.36 
 
 
528 aa  137  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  32.79 
 
 
641 aa  137  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  34.66 
 
 
513 aa  137  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>