More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1889 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
645 aa  1275    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  34.09 
 
 
670 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.42 
 
 
696 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31.06 
 
 
694 aa  271  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  33.03 
 
 
741 aa  270  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 
667 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  30.93 
 
 
794 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.49 
 
 
656 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  30.42 
 
 
752 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.59 
 
 
658 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  30.55 
 
 
701 aa  257  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.28 
 
 
672 aa  257  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.77 
 
 
737 aa  253  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  31.02 
 
 
744 aa  244  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 
607 aa  241  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  30.05 
 
 
614 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  30.72 
 
 
734 aa  237  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  28.14 
 
 
758 aa  237  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  25.64 
 
 
641 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 
746 aa  234  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  27.69 
 
 
758 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.99 
 
 
754 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  28.76 
 
 
738 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.28 
 
 
723 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  30.97 
 
 
638 aa  220  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.3 
 
 
723 aa  220  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.78 
 
 
758 aa  218  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.95 
 
 
611 aa  217  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  32.64 
 
 
725 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  29.21 
 
 
756 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 
729 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  31.8 
 
 
729 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  28.89 
 
 
731 aa  211  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.27 
 
 
758 aa  210  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.29 
 
 
753 aa  210  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  30.18 
 
 
759 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.4 
 
 
764 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  29.94 
 
 
760 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29 
 
 
657 aa  201  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  45.5 
 
 
858 aa  194  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  46.12 
 
 
864 aa  193  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  44.84 
 
 
859 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  26.9 
 
 
721 aa  190  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.2 
 
 
936 aa  188  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.62 
 
 
656 aa  187  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  40.99 
 
 
911 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.21 
 
 
652 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  40.64 
 
 
861 aa  182  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.94 
 
 
597 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.95 
 
 
650 aa  180  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  31.21 
 
 
641 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  32.56 
 
 
696 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  38.36 
 
 
860 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  43.12 
 
 
903 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  28.84 
 
 
632 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 
735 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  28.38 
 
 
665 aa  174  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  26.75 
 
 
582 aa  173  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  29.4 
 
 
650 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.66 
 
 
701 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  39.82 
 
 
284 aa  167  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  39.91 
 
 
701 aa  164  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  35.47 
 
 
632 aa  162  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  30.41 
 
 
744 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  38.97 
 
 
701 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.18 
 
 
703 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.23 
 
 
643 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.82 
 
 
678 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  35.32 
 
 
702 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  37.61 
 
 
717 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  39.74 
 
 
636 aa  152  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  23.22 
 
 
643 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  42.62 
 
 
651 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
675 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.36 
 
 
757 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  40.26 
 
 
513 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  37.33 
 
 
546 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  42.13 
 
 
585 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  37.21 
 
 
431 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  39.01 
 
 
1805 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.43 
 
 
797 aa  144  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.94 
 
 
761 aa  144  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  39.89 
 
 
1119 aa  144  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  30.66 
 
 
645 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  37.09 
 
 
441 aa  143  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 
726 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  36.24 
 
 
724 aa  141  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  39.04 
 
 
713 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  42.22 
 
 
740 aa  140  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
593 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  28.79 
 
 
635 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 
699 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  38.39 
 
 
483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  36.94 
 
 
1207 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  31.94 
 
 
712 aa  137  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
681 aa  137  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  33.47 
 
 
643 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 
738 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  38.36 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.68 
 
 
648 aa  135  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>