More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1406 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  100 
 
 
757 aa  1541    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  49.13 
 
 
735 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  59.15 
 
 
744 aa  880    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  63.02 
 
 
1207 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.33 
 
 
678 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 
643 aa  342  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  43.42 
 
 
902 aa  336  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  43.92 
 
 
902 aa  336  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  45.52 
 
 
583 aa  330  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  42.34 
 
 
737 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
922 aa  293  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
935 aa  277  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
664 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 
945 aa  257  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  38.52 
 
 
717 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.446547  normal  0.266824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2402  sensor protein  37.53 
 
 
619 aa  234  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532539  hitchhiker  0.0000375596 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  52.34 
 
 
441 aa  228  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  52.09 
 
 
431 aa  227  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2806  sensor protein  30.12 
 
 
633 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682487  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.66 
 
 
614 aa  211  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.19 
 
 
758 aa  207  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4764  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  35.77 
 
 
746 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272035  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.6 
 
 
611 aa  204  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  30.33 
 
 
872 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1855  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  30.33 
 
 
872 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.311227  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.59 
 
 
658 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 
794 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5483  CHASE2 domain protein  34.48 
 
 
696 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0712134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  32.14 
 
 
865 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64169e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.78 
 
 
656 aa  190  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  28.48 
 
 
638 aa  188  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.88 
 
 
737 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.02 
 
 
672 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  26.95 
 
 
645 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.12 
 
 
841 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  33.92 
 
 
782 aa  180  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5644  putative Chase2 sensor protein  32.39 
 
 
686 aa  180  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0408867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 
746 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  29.96 
 
 
670 aa  171  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.1 
 
 
696 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  27.86 
 
 
582 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  31.27 
 
 
787 aa  168  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  24.71 
 
 
729 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  30.33 
 
 
734 aa  166  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.61 
 
 
741 aa  165  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  30.05 
 
 
758 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  29.51 
 
 
758 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.96 
 
 
657 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 
665 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  39.37 
 
 
936 aa  162  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  31.51 
 
 
744 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  31.47 
 
 
781 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  31.02 
 
 
696 aa  157  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  26.43 
 
 
756 aa  157  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 
641 aa  157  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  33.01 
 
 
632 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.69 
 
 
656 aa  154  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  28.78 
 
 
783 aa  153  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 
284 aa  151  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  26 
 
 
760 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  31.99 
 
 
752 aa  151  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  37.79 
 
 
479 aa  150  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.5 
 
 
758 aa  150  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.92 
 
 
764 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.67 
 
 
753 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.47 
 
 
754 aa  147  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  30.16 
 
 
725 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 
701 aa  146  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  34.41 
 
 
903 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  25.11 
 
 
759 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.91 
 
 
861 aa  145  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  29.87 
 
 
667 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  26.69 
 
 
675 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  37.79 
 
 
446 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  37.79 
 
 
463 aa  144  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 
645 aa  144  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  33.33 
 
 
487 aa  143  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  35.62 
 
 
860 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  28.86 
 
 
721 aa  142  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  25.75 
 
 
699 aa  142  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 
526 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  35.87 
 
 
462 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  37.79 
 
 
483 aa  141  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25 
 
 
723 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  35.43 
 
 
465 aa  140  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  37.5 
 
 
460 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.95 
 
 
701 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  35.22 
 
 
864 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  37.84 
 
 
528 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  37.18 
 
 
858 aa  138  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  30.82 
 
 
1048 aa  138  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  35.51 
 
 
859 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  38.14 
 
 
532 aa  137  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  30 
 
 
650 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  34.35 
 
 
636 aa  136  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.41 
 
 
597 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  29.57 
 
 
681 aa  136  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.45 
 
 
701 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.81 
 
 
723 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 
523 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>