77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0382 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  100 
 
 
783 aa  1607    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  36.68 
 
 
782 aa  269  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  38.85 
 
 
872 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1855  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  38.85 
 
 
872 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.311227  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  37.1 
 
 
717 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.446547  normal  0.266824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  34.87 
 
 
1048 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  35.92 
 
 
865 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64169e-22 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  34.79 
 
 
787 aa  208  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  35.94 
 
 
643 aa  202  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4764  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.19 
 
 
746 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272035  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  33 
 
 
781 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 
735 aa  174  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  29.56 
 
 
902 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  29.06 
 
 
902 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.4 
 
 
678 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.3 
 
 
841 aa  163  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 
744 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.78 
 
 
757 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 
922 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2806  sensor protein  28.24 
 
 
633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682487  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  28.06 
 
 
583 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  29.43 
 
 
737 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
664 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2402  sensor protein  27.68 
 
 
619 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532539  hitchhiker  0.0000375596 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5483  CHASE2 domain protein  28.14 
 
 
696 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0712134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  28.69 
 
 
925 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.54 
 
 
945 aa  111  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.48 
 
 
935 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5644  putative Chase2 sensor protein  25.3 
 
 
686 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0408867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.44 
 
 
1196 aa  68.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.88 
 
 
1203 aa  67.8  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.69 
 
 
1088 aa  63.9  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.31 
 
 
759 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.02 
 
 
445 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.66 
 
 
445 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  23.5 
 
 
331 aa  57  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.45 
 
 
1711 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.07 
 
 
1343 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  19.25 
 
 
457 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.74 
 
 
597 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.53 
 
 
795 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.53 
 
 
795 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 
828 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  28.03 
 
 
902 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.39 
 
 
1557 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.5 
 
 
860 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.5 
 
 
859 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.94 
 
 
477 aa  50.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.92 
 
 
1760 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  30.07 
 
 
770 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.52 
 
 
324 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  26.71 
 
 
759 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.56 
 
 
758 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  26.95 
 
 
760 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  22.92 
 
 
798 aa  48.9  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0326  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.92 
 
 
628 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415974  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.94 
 
 
753 aa  47.8  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.05 
 
 
902 aa  47.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  25.7 
 
 
729 aa  47.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  31.94 
 
 
756 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.75 
 
 
764 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.07 
 
 
737 aa  46.6  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  23.65 
 
 
500 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.79 
 
 
324 aa  46.6  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.95 
 
 
578 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.95 
 
 
579 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.22 
 
 
680 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.89 
 
 
652 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.95 
 
 
578 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 
2050 aa  45.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.53 
 
 
554 aa  45.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  23.44 
 
 
1097 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
1022 aa  45.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.3 
 
 
486 aa  45.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.69 
 
 
502 aa  44.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  21.17 
 
 
614 aa  44.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.48 
 
 
489 aa  44.3  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>