More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0668 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
701 aa  1438    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  33.57 
 
 
694 aa  335  2e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  30.49 
 
 
746 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  29.69 
 
 
752 aa  313  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.2 
 
 
696 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.53 
 
 
758 aa  278  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 
794 aa  273  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  32.37 
 
 
667 aa  271  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 
744 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 
645 aa  244  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.23 
 
 
672 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  30.72 
 
 
760 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.87 
 
 
657 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.08 
 
 
641 aa  239  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.48 
 
 
656 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  29.3 
 
 
741 aa  238  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.8 
 
 
756 aa  238  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  29.64 
 
 
607 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.1 
 
 
723 aa  236  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.13 
 
 
936 aa  236  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.92 
 
 
753 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.12 
 
 
764 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.93 
 
 
656 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  30.32 
 
 
614 aa  232  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.49 
 
 
723 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.03 
 
 
658 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  30.28 
 
 
650 aa  228  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  30.15 
 
 
725 aa  227  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  31.81 
 
 
696 aa  227  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  31.32 
 
 
670 aa  224  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.2 
 
 
701 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
759 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  39.93 
 
 
701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  27.14 
 
 
729 aa  217  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 
734 aa  216  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  26.66 
 
 
731 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.56 
 
 
703 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  38.87 
 
 
701 aa  214  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  37.41 
 
 
702 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  26.51 
 
 
738 aa  210  8e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.3 
 
 
737 aa  207  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.35 
 
 
758 aa  203  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  24.82 
 
 
758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  25.21 
 
 
758 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  25.68 
 
 
721 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.55 
 
 
754 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  31.62 
 
 
717 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.14 
 
 
611 aa  196  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  37.72 
 
 
593 aa  194  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  28.43 
 
 
638 aa  192  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  28.21 
 
 
665 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  36.79 
 
 
903 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.99 
 
 
744 aa  185  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 
675 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.93 
 
 
861 aa  178  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 
641 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 
860 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  26.31 
 
 
729 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  33.57 
 
 
712 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.58 
 
 
597 aa  167  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  35.31 
 
 
713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  27.94 
 
 
582 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.27 
 
 
797 aa  161  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 
726 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 
724 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  33.45 
 
 
864 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.26 
 
 
652 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  24.43 
 
 
643 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 
699 aa  160  9e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  27.02 
 
 
681 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.59 
 
 
761 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  36.94 
 
 
483 aa  158  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  36.94 
 
 
483 aa  158  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
911 aa  158  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  25.98 
 
 
632 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  33.74 
 
 
636 aa  154  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  37.75 
 
 
284 aa  154  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.79 
 
 
648 aa  154  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.02 
 
 
678 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  27.16 
 
 
744 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.2 
 
 
650 aa  151  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  42.93 
 
 
1093 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
421 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  29.43 
 
 
735 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.46 
 
 
859 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 
632 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.98 
 
 
757 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  35.38 
 
 
421 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  33.48 
 
 
431 aa  144  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  34.7 
 
 
523 aa  144  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  33.78 
 
 
441 aa  143  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
651 aa  141  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  36.71 
 
 
528 aa  141  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  31.56 
 
 
1207 aa  140  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
643 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.08 
 
 
858 aa  138  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.29 
 
 
585 aa  137  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  33.48 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  34.39 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  33.48 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>