More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5187 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  100 
 
 		 758 aa  1516    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  41.95 
 
 		 741 aa  535  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  40.38 
 
 		 734 aa  525  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.35 
 
 		 737 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  33.02 
 
 		 758 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  33.24 
 
 		 758 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  38.09 
 
 		 670 aa  375  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  31.89 
 
 		 746 aa  320  7e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  31.88 
 
 		 744 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.31 
 
 		 696 aa  300  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.14 
 
 		 764 aa  297  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.2 
 
 		 758 aa  296  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.72 
 
 		 723 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 		 754 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  30.71 
 
 		 760 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  31.66 
 
 		 759 aa  283  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.07 
 
 		 723 aa  283  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  33.6 
 
 		 725 aa  280  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  31.98 
 
 		 756 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 		 738 aa  273  8.000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31 
 
 		 753 aa  270  7e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  34.25 
 
 		 729 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 		 794 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.4 
 
 		 656 aa  262  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  30.31 
 
 		 731 aa  259  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.02 
 
 		 672 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.96 
 
 		 658 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  28.86 
 
 		 729 aa  230  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 		 665 aa  229  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  29.89 
 
 		 607 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  29.14 
 
 		 614 aa  217  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  27.39 
 
 		 721 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 		 696 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.55 
 
 		 657 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  29.53 
 
 		 752 aa  207  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  25.7 
 
 		 694 aa  205  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  26.55 
 
 		 701 aa  204  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  30.94 
 
 		 650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  35.47 
 
 		 645 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  28.68 
 
 		 667 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.75 
 
 		 761 aa  193  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  25.34 
 
 		 641 aa  189  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  37.62 
 
 		 717 aa  188  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  35.25 
 
 		 724 aa  186  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.48 
 
 		 656 aa  184  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.59 
 
 		 936 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.49 
 
 		 701 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  28.68 
 
 		 638 aa  174  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.03 
 
 		 611 aa  170  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.03 
 
 		 643 aa  168  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  32.88 
 
 		 701 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  31.86 
 
 		 701 aa  163  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 864 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  38.2 
 
 		 702 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 726 aa  162  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.92 
 
 		 859 aa  161  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.52 
 
 		 703 aa  160  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  24.44 
 
 		 753 aa  160  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.16 
 
 		 861 aa  159  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  30.09 
 
 		 582 aa  158  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  40.07 
 
 		 593 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.48 
 
 		 858 aa  157  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.5 
 
 		 757 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.18 
 
 		 860 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.64 
 
 		 652 aa  154  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.79 
 
 		 597 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  27.99 
 
 		 735 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  34.46 
 
 		 713 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  30.27 
 
 		 645 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  28.65 
 
 		 675 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 		 643 aa  147  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  35.67 
 
 		 358 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  28.46 
 
 		 643 aa  146  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 911 aa  145  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.3 
 
 		 678 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 		 744 aa  144  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.05 
 
 		 637 aa  144  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  32.34 
 
 		 903 aa  144  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31.58 
 
 		 797 aa  141  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  32.78 
 
 		 632 aa  141  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  26.37 
 
 		 712 aa  138  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  38.86 
 
 		 1093 aa  137  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  32.68 
 
 		 1119 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  31.88 
 
 		 431 aa  137  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  36.36 
 
 		 636 aa  137  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 		 651 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  34.09 
 
 		 441 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  29.76 
 
 		 635 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  35.68 
 
 		 1805 aa  134  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  31.18 
 
 		 699 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  34.23 
 
 		 483 aa  133  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  33.78 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.7 
 
 		 825 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 		 284 aa  130  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.36 
 
 		 585 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  40.21 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  31.99 
 
 		 708 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 		 681 aa  126  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1407  metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 		 691 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>