More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0015 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
284 aa  570  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  62.5 
 
 
641 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  40.15 
 
 
746 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  35.51 
 
 
614 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  45.62 
 
 
696 aa  175  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  41.33 
 
 
607 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  44.24 
 
 
656 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  39.59 
 
 
971 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  43.32 
 
 
672 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  39.82 
 
 
645 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  42.29 
 
 
859 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.77 
 
 
658 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  37 
 
 
638 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  42.34 
 
 
864 aa  165  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  41.18 
 
 
636 aa  165  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  38.57 
 
 
675 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  38.43 
 
 
860 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
858 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  32.04 
 
 
681 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  38.91 
 
 
1207 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  37.4 
 
 
701 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  41.63 
 
 
969 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  39.35 
 
 
911 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.9 
 
 
737 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  37.61 
 
 
861 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  40.62 
 
 
735 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  38.01 
 
 
741 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  31.93 
 
 
699 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.6 
 
 
757 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  38.77 
 
 
483 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  38.39 
 
 
483 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.61 
 
 
611 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  41.5 
 
 
903 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  35.42 
 
 
632 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 
759 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  36.36 
 
 
729 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.59 
 
 
764 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  44.12 
 
 
431 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  43.63 
 
 
441 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  33.83 
 
 
760 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.49 
 
 
758 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.97 
 
 
585 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  36.13 
 
 
632 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  34.15 
 
 
725 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 
756 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.28 
 
 
753 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  34.82 
 
 
734 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  33.1 
 
 
758 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  34.35 
 
 
421 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  32.44 
 
 
721 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  33.45 
 
 
758 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.97 
 
 
701 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  35.86 
 
 
744 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  38.59 
 
 
515 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  39.19 
 
 
518 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  36.92 
 
 
701 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.47 
 
 
936 aa  142  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  36.45 
 
 
701 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.47 
 
 
656 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  40.97 
 
 
518 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.23 
 
 
723 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  35.42 
 
 
696 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.23 
 
 
723 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  41.08 
 
 
1093 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.96 
 
 
657 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  37.18 
 
 
364 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  39.04 
 
 
981 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  35.85 
 
 
717 aa  138  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  37.33 
 
 
513 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  34.47 
 
 
670 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.07 
 
 
678 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  40.11 
 
 
1020 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  35.91 
 
 
712 aa  135  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  34.23 
 
 
702 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.25 
 
 
694 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 
794 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  42.54 
 
 
1160 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  32.55 
 
 
447 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  36.05 
 
 
713 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
641 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.21 
 
 
643 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  39.81 
 
 
358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  34.42 
 
 
729 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 
591 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  40.96 
 
 
500 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  35.47 
 
 
421 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.11 
 
 
758 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  39.27 
 
 
549 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  30.88 
 
 
645 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  32.22 
 
 
643 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
667 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  34.08 
 
 
582 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.81 
 
 
797 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  38.67 
 
 
469 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  39.58 
 
 
1153 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  36.07 
 
 
752 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.95 
 
 
1089 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  30.03 
 
 
738 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  37.62 
 
 
546 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.51 
 
 
637 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>