More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0296 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  100 
 
 		 672 aa  1359    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  60.49 
 
 		 658 aa  789    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  94.5 
 
 		 656 aa  1205    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.33 
 
 		 696 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 		 746 aa  351  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.41 
 
 		 758 aa  343  7e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  33.53 
 
 		 794 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.12 
 
 		 737 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  35.25 
 
 		 638 aa  309  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  33.22 
 
 		 614 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 		 738 aa  289  9e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.89 
 
 		 741 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  33.59 
 
 		 670 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  32.77 
 
 		 729 aa  278  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  30.73 
 
 		 758 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  31.01 
 
 		 744 aa  275  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  30.73 
 
 		 758 aa  274  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 		 752 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.83 
 
 		 723 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  30.63 
 
 		 734 aa  266  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.77 
 
 		 723 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.02 
 
 		 758 aa  263  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 		 667 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  30.13 
 
 		 701 aa  261  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  32.44 
 
 		 645 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  31.67 
 
 		 725 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 		 756 aa  254  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.97 
 
 		 753 aa  252  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 		 665 aa  252  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.22 
 
 		 694 aa  250  7e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.94 
 
 		 754 aa  249  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.67 
 
 		 764 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.55 
 
 		 611 aa  246  8e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  31.15 
 
 		 759 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 760 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  29.24 
 
 		 721 aa  239  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 		 731 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 		 641 aa  232  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  28.14 
 
 		 729 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.78 
 
 		 657 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  28.8 
 
 		 582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  29.54 
 
 		 607 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.32 
 
 		 761 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.72 
 
 		 757 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 		 744 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.26 
 
 		 936 aa  204  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.41 
 
 		 656 aa  203  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  27.26 
 
 		 696 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  30.42 
 
 		 735 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  46.05 
 
 		 431 aa  194  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  46.49 
 
 		 441 aa  194  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.98 
 
 		 652 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.18 
 
 		 597 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  40.62 
 
 		 860 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.04 
 
 		 701 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  28.25 
 
 		 632 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.3 
 
 		 643 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  39.57 
 
 		 861 aa  179  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.83 
 
 		 678 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 		 632 aa  177  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  38.63 
 
 		 859 aa  177  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  39.91 
 
 		 858 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  41.06 
 
 		 1207 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  33.89 
 
 		 650 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  41.28 
 
 		 284 aa  176  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  27.29 
 
 		 717 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  40.93 
 
 		 528 aa  171  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.7 
 
 		 703 aa  168  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  37.76 
 
 		 864 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  28.85 
 
 		 635 aa  167  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  42.54 
 
 		 702 aa  167  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2916  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.95 
 
 		 575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0753379  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  29.58 
 
 		 641 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  38.27 
 
 		 911 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  23.99 
 
 		 643 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  40.62 
 
 		 903 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  36.53 
 
 		 701 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.51 
 
 		 650 aa  158  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  41.33 
 
 		 585 aa  157  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  36.07 
 
 		 701 aa  157  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  31.07 
 
 		 675 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.55 
 
 		 825 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  37.4 
 
 		 713 aa  151  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 		 643 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  38.6 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  36.04 
 
 		 681 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  36.79 
 
 		 526 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  33.97 
 
 		 524 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  38.65 
 
 		 526 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  32.84 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  33.95 
 
 		 726 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  31.14 
 
 		 699 aa  145  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  32.84 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 		 479 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 712 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 		 724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  25.46 
 
 		 753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  34.22 
 
 		 483 aa  141  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  35.5 
 
 		 546 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  33.78 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>