More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2543 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
712 aa  1470    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  31.89 
 
 
726 aa  343  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  31.46 
 
 
724 aa  321  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  34.32 
 
 
702 aa  320  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  27.8 
 
 
701 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  27.56 
 
 
701 aa  270  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.01 
 
 
637 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  30.16 
 
 
643 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  32.34 
 
 
713 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  30.18 
 
 
651 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.44 
 
 
648 aa  208  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  34.19 
 
 
696 aa  196  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.44 
 
 
758 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.86 
 
 
936 aa  183  8.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.13 
 
 
696 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 
746 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  33.57 
 
 
701 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.48 
 
 
694 aa  171  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.56 
 
 
737 aa  170  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.39 
 
 
657 aa  170  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 
903 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.78 
 
 
701 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  32.65 
 
 
911 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
794 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  32.53 
 
 
734 aa  167  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.36 
 
 
656 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 
593 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 
744 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  34.8 
 
 
752 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.92 
 
 
764 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  34.46 
 
 
717 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 
861 aa  158  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  38.04 
 
 
759 aa  158  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  34.12 
 
 
741 aa  158  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  34.24 
 
 
760 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 
858 aa  157  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.77 
 
 
864 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  28.79 
 
 
860 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  36.99 
 
 
650 aa  153  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.63 
 
 
703 aa  153  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.19 
 
 
753 aa  153  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 
859 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  32.63 
 
 
614 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  27.24 
 
 
636 aa  147  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 
756 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  37.5 
 
 
670 aa  145  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  35.29 
 
 
638 aa  145  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  29.97 
 
 
758 aa  145  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  29.97 
 
 
758 aa  144  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.2 
 
 
656 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.13 
 
 
761 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.72 
 
 
672 aa  142  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  32.6 
 
 
675 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  34.29 
 
 
641 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.49 
 
 
658 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  28.73 
 
 
358 aa  140  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  29.79 
 
 
483 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  30.38 
 
 
483 aa  140  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  35.65 
 
 
699 aa  140  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.37 
 
 
758 aa  138  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 
744 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 
681 aa  137  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.12 
 
 
754 aa  137  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.63 
 
 
797 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  35.91 
 
 
284 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.26 
 
 
645 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.2 
 
 
723 aa  134  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  32.64 
 
 
729 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 
611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  30.13 
 
 
740 aa  132  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.04 
 
 
723 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 
665 aa  130  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  33.8 
 
 
607 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.77 
 
 
757 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 
731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  33.98 
 
 
667 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  32.39 
 
 
431 aa  129  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  32.39 
 
 
441 aa  128  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.11 
 
 
652 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 
735 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  31.54 
 
 
526 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 
483 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.15 
 
 
500 aa  125  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  29.86 
 
 
487 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  34.95 
 
 
725 aa  125  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 
524 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  32.99 
 
 
635 aa  124  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  31.1 
 
 
729 aa  123  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.99 
 
 
598 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.433713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  34.31 
 
 
421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  29.59 
 
 
1207 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
738 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 
479 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.51 
 
 
518 aa  120  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  33.9 
 
 
738 aa  118  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  32.73 
 
 
529 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.71 
 
 
465 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  32.41 
 
 
1093 aa  117  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  32.49 
 
 
447 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  29.22 
 
 
721 aa  117  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>