More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2265 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
598 aa  1224    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.433713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  28.85 
 
 
744 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  28.99 
 
 
712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
858 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  27.92 
 
 
794 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  28.24 
 
 
859 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  27.42 
 
 
864 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.78 
 
 
694 aa  108  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  27.3 
 
 
741 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
593 aa  107  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.09 
 
 
657 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  25.55 
 
 
702 aa  104  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  29.15 
 
 
726 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  34.02 
 
 
969 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.54 
 
 
656 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 
903 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  27.95 
 
 
746 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.58 
 
 
737 aa  99.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  34.36 
 
 
971 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  32.49 
 
 
729 aa  99.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  32.12 
 
 
650 aa  99.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.12 
 
 
754 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  26.44 
 
 
701 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  35.03 
 
 
645 aa  96.3  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.44 
 
 
701 aa  95.1  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.44 
 
 
614 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.62 
 
 
696 aa  94.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.85 
 
 
672 aa  94.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.85 
 
 
656 aa  94  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  29.89 
 
 
713 aa  93.6  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 
756 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  28.38 
 
 
701 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  29.15 
 
 
731 aa  92.8  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  23.93 
 
 
513 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  26.54 
 
 
758 aa  91.3  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  26.07 
 
 
758 aa  90.9  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.8 
 
 
648 aa  90.5  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.63 
 
 
861 aa  90.5  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  32.86 
 
 
670 aa  90.1  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  24.6 
 
 
696 aa  90.1  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.09 
 
 
758 aa  89.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 
734 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  26.96 
 
 
860 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.8 
 
 
723 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  26.09 
 
 
911 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
607 aa  87.4  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.8 
 
 
1020 aa  87.4  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  28.87 
 
 
760 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  29.74 
 
 
752 aa  87  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.31 
 
 
758 aa  86.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
483 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.54 
 
 
753 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 
759 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.6 
 
 
701 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.29 
 
 
723 aa  84.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  27.51 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  27.84 
 
 
717 aa  84  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 
464 aa  84  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  28.31 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  30.39 
 
 
636 aa  82.8  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 
632 aa  82.8  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.7 
 
 
764 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  28.25 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  28.24 
 
 
638 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.32 
 
 
611 aa  81.3  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  26.64 
 
 
724 aa  80.9  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.83 
 
 
936 aa  80.5  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  31.18 
 
 
817 aa  80.5  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.16 
 
 
652 aa  80.1  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  31.79 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  27.83 
 
 
546 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  31.44 
 
 
822 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  26.48 
 
 
675 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  32 
 
 
643 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  30.05 
 
 
735 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  33.69 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.29 
 
 
577 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 
651 aa  78.2  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  23.89 
 
 
641 aa  77.8  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.93 
 
 
658 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.22 
 
 
637 aa  77.8  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 
665 aa  77.4  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  32.89 
 
 
483 aa  77  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  32.89 
 
 
483 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.81 
 
 
879 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 
536 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  27.51 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  26.14 
 
 
643 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 
738 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  24.32 
 
 
546 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  25.38 
 
 
797 aa  74.7  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  29.87 
 
 
641 aa  74.7  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  35.62 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 
667 aa  75.1  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.53 
 
 
703 aa  75.1  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 
528 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 
528 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  24.58 
 
 
744 aa  73.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 
528 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  33.78 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>