More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9841 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  100 
 
 		 449 aa  912    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  39.57 
 
 		 614 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  39.49 
 
 		 464 aa  136  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.3 
 
 		 672 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.04 
 
 		 656 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  36.28 
 
 		 437 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  43.01 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.1 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.73 
 
 		 858 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  32.42 
 
 		 860 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 		 735 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.18 
 
 		 611 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  39.25 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 		 859 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  31.91 
 
 		 746 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 		 459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5259  putative adenylate/guanylate cyclase  33.14 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 861 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  31.5 
 
 		 641 aa  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  36.82 
 
 		 632 aa  113  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  33.66 
 
 		 741 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.52 
 
 		 658 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  39.77 
 
 		 364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 		 911 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.65 
 
 		 757 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  34.67 
 
 		 523 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  29.04 
 
 		 437 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 		 607 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  29.09 
 
 		 758 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 		 1207 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 		 665 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  33.89 
 
 		 1153 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  32.04 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  29.09 
 
 		 758 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6815  adenylate/guanylate cyclase  41.28 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.741432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.02 
 
 		 696 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.19 
 
 		 584 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 		 794 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  28.45 
 
 		 667 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  29.04 
 
 		 437 aa  106  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  31.71 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.6 
 
 		 584 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.63 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  34.53 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  28.87 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.82 
 
 		 678 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2096  adenylate/guanylate cyclase  41.27 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0716073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 		 744 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  36.17 
 
 		 358 aa  104  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  34.34 
 
 		 971 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 		 864 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  32.32 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 		 675 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.82 
 
 		 737 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  34.13 
 
 		 729 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  33.8 
 
 		 645 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  36.23 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  33.84 
 
 		 969 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  36.99 
 
 		 1156 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  35.78 
 
 		 632 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  36.62 
 
 		 643 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2916  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.02 
 
 		 575 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0753379  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  31.63 
 
 		 638 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  27.79 
 
 		 636 aa  100  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.27 
 
 		 585 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.36 
 
 		 529 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  34.58 
 
 		 641 aa  99.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 		 421 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.91 
 
 		 500 aa  99.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  31.82 
 
 		 1020 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  37.14 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 		 681 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  31.73 
 
 		 591 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.11 
 
 		 723 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.67 
 
 		 797 aa  97.4  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  29.65 
 
 		 729 aa  97.1  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  36.17 
 
 		 518 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  34.67 
 
 		 822 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  29.08 
 
 		 431 aa  97.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 		 903 aa  96.7  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.57 
 
 		 723 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  32.24 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.69 
 
 		 879 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  25.57 
 
 		 760 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  38.82 
 
 		 713 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  39.35 
 
 		 564 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  36.57 
 
 		 571 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  32.24 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  34.55 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  29.74 
 
 		 645 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  30.53 
 
 		 701 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.43 
 
 		 1180 aa  94.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 		 643 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  25.57 
 
 		 759 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  30.05 
 
 		 731 aa  94  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  35.06 
 
 		 1172 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.91 
 
 		 758 aa  93.2  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  32.52 
 
 		 734 aa  93.2  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  31.77 
 
 		 558 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 		 756 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>