More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3461 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 459 aa  899    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  55.25 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  34.89 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6815  adenylate/guanylate cyclase  56.31 
 
 		 428 aa  202  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.741432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  33.13 
 
 		 702 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.5 
 
 		 737 aa  123  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  24.88 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  37.34 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  36.06 
 
 		 903 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  25.06 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.88 
 
 		 864 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  35.23 
 
 		 741 aa  117  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  33.95 
 
 		 358 aa  116  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.9 
 
 		 735 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  30.64 
 
 		 614 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.7 
 
 		 641 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  31.14 
 
 		 734 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  31.63 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  31.13 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  33.49 
 
 		 636 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 464 aa  113  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  39.05 
 
 		 364 aa  113  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  30.94 
 
 		 717 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 		 861 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  31.07 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  29.68 
 
 		 911 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 		 607 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 		 1119 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 		 859 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 		 860 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  29.47 
 
 		 701 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2096  adenylate/guanylate cyclase  39.66 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0716073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 		 858 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.2 
 
 		 758 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  32.66 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.77 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  29.47 
 
 		 701 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  30.88 
 
 		 699 aa  107  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.99 
 
 		 758 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  30.69 
 
 		 746 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  29.83 
 
 		 681 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  26.94 
 
 		 696 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.39 
 
 		 500 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  29.52 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  35.71 
 
 		 650 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  30.45 
 
 		 638 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 		 726 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  32.16 
 
 		 971 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  31.64 
 
 		 651 aa  103  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  30.71 
 
 		 513 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  27.04 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  31.4 
 
 		 758 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 		 794 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 		 675 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  28.23 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  30.92 
 
 		 758 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 		 729 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 		 488 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.63 
 
 		 757 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 		 486 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 		 486 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 		 486 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  34.4 
 
 		 431 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  25.95 
 
 		 712 aa  100  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  31.1 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01760  family 3 adenylate cyclase  35.52 
 
 		 494 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  34.8 
 
 		 447 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.24 
 
 		 703 aa  97.8  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 		 665 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  31.39 
 
 		 593 aa  97.1  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  32.6 
 
 		 1093 aa  97.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.19 
 
 		 936 aa  97.1  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 		 532 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  32.72 
 
 		 969 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 		 645 aa  97.1  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 		 488 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 		 744 aa  96.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  28.92 
 
 		 1805 aa  96.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  35.96 
 
 		 570 aa  96.7  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.1 
 
 		 656 aa  96.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  29.49 
 
 		 670 aa  96.3  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.6 
 
 		 696 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  35.24 
 
 		 514 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.68 
 
 		 622 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.05 
 
 		 611 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 		 529 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.58 
 
 		 701 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  33.67 
 
 		 729 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  31.44 
 
 		 740 aa  94.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 		 731 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  30.7 
 
 		 523 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  31.16 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  31.58 
 
 		 546 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.54 
 
 		 648 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  32.52 
 
 		 399 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.12 
 
 		 657 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.08 
 
 		 584 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  34.93 
 
 		 367 aa  93.6  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  31.8 
 
 		 725 aa  93.6  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.05 
 
 		 754 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>