More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3177 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  100 
 
 
971 aa  1928    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  82.9 
 
 
969 aa  1561    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  50.86 
 
 
981 aa  831    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  35.39 
 
 
1020 aa  306  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
531 aa  177  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  41.63 
 
 
614 aa  172  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  31.9 
 
 
903 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  39.59 
 
 
284 aa  170  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  39.47 
 
 
638 aa  164  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
958 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  37.61 
 
 
641 aa  153  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 
864 aa  150  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 
859 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  26.44 
 
 
860 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 
665 aa  149  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.19 
 
 
611 aa  146  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.56 
 
 
858 aa  144  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  35.85 
 
 
513 aa  142  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.04 
 
 
861 aa  141  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  38.43 
 
 
523 aa  141  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  34.54 
 
 
702 aa  141  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  37.13 
 
 
380 aa  141  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  37.33 
 
 
515 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  36.44 
 
 
518 aa  139  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 
758 aa  139  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  40.98 
 
 
746 aa  139  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.39 
 
 
585 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.62 
 
 
879 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 
794 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  37.38 
 
 
607 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.95 
 
 
696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 
479 aa  134  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36 
 
 
672 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
702 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  40.86 
 
 
364 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  36.48 
 
 
632 aa  132  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  30.88 
 
 
817 aa  132  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 
822 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.56 
 
 
656 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  34.84 
 
 
403 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 
911 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.21 
 
 
815 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  37.78 
 
 
632 aa  130  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  33.63 
 
 
696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  36.16 
 
 
518 aa  129  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36 
 
 
701 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.79 
 
 
1017 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  36.79 
 
 
528 aa  128  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
529 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  33.33 
 
 
431 aa  127  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  35.14 
 
 
729 aa  126  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  33.77 
 
 
441 aa  126  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  32.41 
 
 
1134 aa  125  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  35.65 
 
 
1207 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.22 
 
 
597 aa  126  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
1631 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 
645 aa  125  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  33.46 
 
 
358 aa  125  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  32.78 
 
 
752 aa  125  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  32.88 
 
 
717 aa  124  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  36.98 
 
 
582 aa  124  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  35.56 
 
 
744 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  34.19 
 
 
735 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  34.7 
 
 
526 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
725 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 
658 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 
675 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  35.59 
 
 
738 aa  122  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.73 
 
 
737 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  34.88 
 
 
670 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  41.22 
 
 
1081 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  39.19 
 
 
439 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  33.68 
 
 
421 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.23 
 
 
1004 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  32.48 
 
 
546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 
447 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  37.29 
 
 
524 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.64 
 
 
1089 aa  119  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.97 
 
 
657 aa  119  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 
734 aa  118  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 
887 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  39.35 
 
 
536 aa  118  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.97 
 
 
656 aa  118  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  41.81 
 
 
549 aa  118  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  32.31 
 
 
636 aa  117  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  29.96 
 
 
681 aa  118  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.37 
 
 
652 aa  117  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  33.79 
 
 
744 aa  117  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.62 
 
 
483 aa  117  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 
421 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  33.92 
 
 
758 aa  117  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  33.63 
 
 
741 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.22 
 
 
761 aa  117  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  30.92 
 
 
483 aa  116  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
361 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.22 
 
 
1080 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  30.92 
 
 
483 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  33.19 
 
 
465 aa  115  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  37.96 
 
 
532 aa  115  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>