More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1196 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  87.77 
 
 
1017 aa  1684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  54.83 
 
 
997 aa  952    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  100 
 
 
1004 aa  1989    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  45.75 
 
 
995 aa  749    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.45 
 
 
563 aa  241  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.91 
 
 
1332 aa  220  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.48 
 
 
961 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.41 
 
 
957 aa  217  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.58 
 
 
1480 aa  212  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  41.99 
 
 
708 aa  198  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.14 
 
 
590 aa  194  6e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  42.75 
 
 
455 aa  190  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  39.55 
 
 
706 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  38.57 
 
 
413 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  28.79 
 
 
612 aa  177  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  28.1 
 
 
584 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  34.95 
 
 
366 aa  171  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.22 
 
 
572 aa  170  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  40.5 
 
 
687 aa  169  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  40.67 
 
 
649 aa  168  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  34.56 
 
 
644 aa  166  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  33.64 
 
 
423 aa  166  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  36.16 
 
 
716 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  37.64 
 
 
649 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  40.07 
 
 
563 aa  164  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.97 
 
 
678 aa  164  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  35.93 
 
 
648 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  39.07 
 
 
535 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  29.19 
 
 
566 aa  163  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  34.44 
 
 
705 aa  163  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  41.3 
 
 
683 aa  162  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  35.21 
 
 
631 aa  162  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.74 
 
 
507 aa  160  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.05 
 
 
486 aa  158  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.59 
 
 
792 aa  155  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  35.79 
 
 
705 aa  154  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  32.69 
 
 
443 aa  152  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  32.61 
 
 
379 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  32.92 
 
 
474 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  32.24 
 
 
459 aa  151  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  32.92 
 
 
474 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.94 
 
 
480 aa  151  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  31.67 
 
 
477 aa  151  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  34.47 
 
 
634 aa  150  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
467 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.34 
 
 
482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  33.23 
 
 
463 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  35.1 
 
 
460 aa  149  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  35.51 
 
 
543 aa  149  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  37.83 
 
 
365 aa  148  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.22 
 
 
748 aa  148  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
361 aa  148  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  34.36 
 
 
469 aa  147  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  37.63 
 
 
470 aa  147  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  32.93 
 
 
462 aa  146  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  28.09 
 
 
438 aa  146  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  28.02 
 
 
1087 aa  146  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  36.6 
 
 
376 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.57 
 
 
388 aa  145  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  30.18 
 
 
474 aa  145  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  36.63 
 
 
660 aa  145  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  31.85 
 
 
464 aa  145  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
570 aa  145  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  36.09 
 
 
451 aa  144  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  36.5 
 
 
723 aa  144  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  33.98 
 
 
364 aa  144  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  36.3 
 
 
637 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  32.94 
 
 
1083 aa  144  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
2161 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.93 
 
 
465 aa  140  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  33.45 
 
 
536 aa  140  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  28.32 
 
 
1087 aa  140  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  35.42 
 
 
645 aa  140  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.04 
 
 
447 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.49 
 
 
385 aa  140  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  33.83 
 
 
657 aa  139  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.93 
 
 
497 aa  138  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  33.83 
 
 
643 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  30.63 
 
 
465 aa  138  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  33.68 
 
 
754 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  34.85 
 
 
377 aa  137  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.53 
 
 
516 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.34 
 
 
447 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.18 
 
 
423 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  35.23 
 
 
1100 aa  135  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  30.96 
 
 
630 aa  134  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  31.64 
 
 
1082 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  32.39 
 
 
447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  30.6 
 
 
637 aa  132  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  36.53 
 
 
846 aa  132  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  30 
 
 
1079 aa  131  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  26.11 
 
 
429 aa  131  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  28.82 
 
 
717 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  31.64 
 
 
472 aa  129  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  34.24 
 
 
381 aa  126  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  32.75 
 
 
642 aa  126  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  34.19 
 
 
410 aa  126  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  35.42 
 
 
502 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.5 
 
 
606 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  31.85 
 
 
885 aa  124  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>