More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0643 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  100 
 
 
708 aa  1439    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  49.86 
 
 
706 aa  723    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  44.85 
 
 
687 aa  571  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  36.9 
 
 
705 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  33.38 
 
 
716 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  33.52 
 
 
705 aa  363  6e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.95 
 
 
678 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  33.78 
 
 
644 aa  262  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  52.14 
 
 
455 aa  259  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
648 aa  257  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  34.35 
 
 
643 aa  254  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  33.97 
 
 
657 aa  253  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  32.95 
 
 
649 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  32.45 
 
 
645 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  42.86 
 
 
631 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  44.2 
 
 
563 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  27.16 
 
 
885 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.86 
 
 
995 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  43.97 
 
 
1004 aa  196  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  35.4 
 
 
634 aa  196  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  45.42 
 
 
997 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  38.85 
 
 
366 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.48 
 
 
1017 aa  190  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.39 
 
 
590 aa  189  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
880 aa  187  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 
521 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.17 
 
 
423 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  39.09 
 
 
1100 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  42.86 
 
 
381 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  37.17 
 
 
474 aa  181  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.27 
 
 
447 aa  180  9e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  39.39 
 
 
470 aa  180  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  38.67 
 
 
637 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.94 
 
 
467 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  37.88 
 
 
465 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  38.8 
 
 
438 aa  177  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  30.74 
 
 
723 aa  177  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.5 
 
 
465 aa  177  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  40.39 
 
 
469 aa  177  8e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  36.29 
 
 
612 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.56 
 
 
447 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
906 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
875 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  40.98 
 
 
570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  36.96 
 
 
683 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  34.94 
 
 
543 aa  174  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  38.35 
 
 
642 aa  174  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  39.92 
 
 
365 aa  174  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  36 
 
 
447 aa  174  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.06 
 
 
572 aa  173  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  36.43 
 
 
379 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.73 
 
 
486 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.94 
 
 
482 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  36.47 
 
 
649 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  35.86 
 
 
1087 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  36.47 
 
 
846 aa  171  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
361 aa  171  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.31 
 
 
1332 aa  170  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  36.88 
 
 
642 aa  170  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  37.78 
 
 
462 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  27.05 
 
 
643 aa  169  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  37.4 
 
 
445 aa  169  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  34.19 
 
 
474 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  34.19 
 
 
474 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  34.8 
 
 
477 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  35.82 
 
 
463 aa  167  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  37.05 
 
 
535 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  36.6 
 
 
637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  31.52 
 
 
660 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  34.23 
 
 
1079 aa  165  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  35.06 
 
 
1087 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  39.27 
 
 
451 aa  164  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.96 
 
 
388 aa  164  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  42.23 
 
 
563 aa  164  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  34.39 
 
 
1082 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  36.18 
 
 
445 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.99 
 
 
748 aa  163  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.44 
 
 
1480 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  34.72 
 
 
1083 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  38.66 
 
 
467 aa  161  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  33.46 
 
 
413 aa  161  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  36.18 
 
 
404 aa  160  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  35.83 
 
 
536 aa  160  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  36.47 
 
 
775 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  40.31 
 
 
853 aa  157  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  33.09 
 
 
410 aa  158  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.52 
 
 
480 aa  158  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  30.46 
 
 
710 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.59 
 
 
507 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  34.83 
 
 
460 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  37.73 
 
 
708 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  33.6 
 
 
443 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1335  serine phosphatase  25.09 
 
 
636 aa  154  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  36.65 
 
 
376 aa  153  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  36.16 
 
 
453 aa  153  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  34.29 
 
 
464 aa  153  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.17 
 
 
792 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
894 aa  153  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  25.03 
 
 
785 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  33.33 
 
 
633 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>