More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0060 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  49.86 
 
 
708 aa  723    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  100 
 
 
706 aa  1441    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  39.59 
 
 
687 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
705 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  31.78 
 
 
716 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  33.71 
 
 
705 aa  363  7.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.88 
 
 
678 aa  263  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  48.68 
 
 
455 aa  249  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  31.37 
 
 
648 aa  241  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  31.64 
 
 
644 aa  239  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  40 
 
 
631 aa  231  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  29.48 
 
 
657 aa  226  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  31.73 
 
 
645 aa  226  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  30.57 
 
 
649 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  29.6 
 
 
643 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  43.12 
 
 
563 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  26.53 
 
 
885 aa  206  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  30.08 
 
 
723 aa  196  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.55 
 
 
995 aa  193  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.15 
 
 
1004 aa  186  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  40.62 
 
 
637 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.58 
 
 
1017 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  40.53 
 
 
683 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  39.59 
 
 
1100 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  31.51 
 
 
535 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.62 
 
 
590 aa  183  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  37.75 
 
 
438 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  38.1 
 
 
365 aa  180  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.63 
 
 
572 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  33.96 
 
 
634 aa  180  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  39.21 
 
 
570 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  27.89 
 
 
660 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
906 aa  177  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  30.75 
 
 
521 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  40.24 
 
 
451 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  36.73 
 
 
1079 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  35.71 
 
 
366 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  37.9 
 
 
361 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
875 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.59 
 
 
997 aa  170  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
880 aa  170  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  35.41 
 
 
536 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.68 
 
 
486 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  34.44 
 
 
846 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  34.22 
 
 
413 aa  169  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
894 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  37.21 
 
 
1082 aa  165  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  37.86 
 
 
381 aa  165  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  33.01 
 
 
502 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  39.44 
 
 
563 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  31.71 
 
 
543 aa  163  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  38.02 
 
 
642 aa  163  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  36.33 
 
 
637 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.27 
 
 
480 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  37.64 
 
 
853 aa  161  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  29.21 
 
 
710 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
474 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
474 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.29 
 
 
423 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  32.8 
 
 
612 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.1 
 
 
507 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  38.84 
 
 
472 aa  158  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  34.57 
 
 
775 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 
642 aa  158  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  34.01 
 
 
1087 aa  158  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  33.45 
 
 
443 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  35.51 
 
 
445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  36.33 
 
 
649 aa  157  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  34.69 
 
 
445 aa  157  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  33.6 
 
 
1087 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  35.92 
 
 
1083 aa  156  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  24.81 
 
 
643 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  35.07 
 
 
474 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  33.7 
 
 
447 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.74 
 
 
1480 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.94 
 
 
482 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  34.45 
 
 
376 aa  154  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.95 
 
 
388 aa  154  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.7 
 
 
447 aa  154  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  33.2 
 
 
467 aa  154  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  36.06 
 
 
463 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 
364 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  34.41 
 
 
410 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  35.83 
 
 
708 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.7 
 
 
447 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  38.89 
 
 
469 aa  152  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  33.07 
 
 
404 aa  151  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.67 
 
 
467 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  35.96 
 
 
462 aa  150  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  34.07 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  33.98 
 
 
465 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  34.85 
 
 
754 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.46 
 
 
792 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.59 
 
 
465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  33.83 
 
 
391 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.86 
 
 
396 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  34.7 
 
 
460 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  33.88 
 
 
684 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.83 
 
 
957 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  32.86 
 
 
650 aa  145  3e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>