More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0663 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
846 aa  1649    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  41.8 
 
 
455 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.76 
 
 
482 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  43.7 
 
 
748 aa  171  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  36.5 
 
 
474 aa  170  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  36.5 
 
 
474 aa  170  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  36.47 
 
 
708 aa  170  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  34.44 
 
 
706 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.09 
 
 
563 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  35.9 
 
 
477 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  36.47 
 
 
460 aa  163  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  35.96 
 
 
463 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  37.65 
 
 
366 aa  158  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  37.13 
 
 
462 aa  158  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  38.75 
 
 
469 aa  158  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  33.71 
 
 
474 aa  157  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.13 
 
 
465 aa  157  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  36.13 
 
 
465 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  36.14 
 
 
687 aa  157  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  39.93 
 
 
470 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  38.34 
 
 
438 aa  156  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  34.06 
 
 
642 aa  155  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  35.48 
 
 
1079 aa  154  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  33.21 
 
 
445 aa  151  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  32.51 
 
 
716 aa  151  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.09 
 
 
961 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.78 
 
 
467 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 
649 aa  149  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  35.17 
 
 
705 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  33.22 
 
 
445 aa  148  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.65 
 
 
957 aa  148  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.95 
 
 
447 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  33.12 
 
 
642 aa  147  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  34.88 
 
 
631 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  34.34 
 
 
447 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.21 
 
 
1480 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.08 
 
 
447 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  35.55 
 
 
1087 aa  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
423 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.1 
 
 
995 aa  144  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  34.43 
 
 
410 aa  144  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  35.16 
 
 
1087 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
660 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  34.83 
 
 
413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  30.62 
 
 
637 aa  142  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  35.33 
 
 
637 aa  140  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  33.73 
 
 
1100 aa  140  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  38.22 
 
 
563 aa  140  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  37.7 
 
 
683 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.06 
 
 
590 aa  139  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  32.73 
 
 
536 aa  138  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.14 
 
 
507 aa  138  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.08 
 
 
1332 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  34.48 
 
 
723 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  35.52 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  34.8 
 
 
683 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.66 
 
 
486 aa  134  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  32.4 
 
 
443 aa  133  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  33.07 
 
 
775 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  36.17 
 
 
634 aa  133  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
364 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  34.05 
 
 
644 aa  132  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  25.35 
 
 
404 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.1 
 
 
572 aa  131  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  32.43 
 
 
684 aa  130  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  31.64 
 
 
423 aa  130  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  32.93 
 
 
467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.87 
 
 
678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  32.94 
 
 
1082 aa  129  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  32.87 
 
 
853 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.89 
 
 
388 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.47 
 
 
497 aa  128  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  31.46 
 
 
502 aa  128  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.36 
 
 
1004 aa  128  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  32.31 
 
 
400 aa  128  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  30.94 
 
 
472 aa  128  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  33.73 
 
 
262 aa  127  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  32.61 
 
 
705 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  30.5 
 
 
378 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  30.53 
 
 
429 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  36.09 
 
 
649 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  34.03 
 
 
410 aa  125  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  30.71 
 
 
1083 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  38.76 
 
 
688 aa  124  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  33.95 
 
 
535 aa  124  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  29.24 
 
 
612 aa  124  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  34.59 
 
 
365 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.67 
 
 
496 aa  122  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.43 
 
 
997 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
361 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  37.4 
 
 
693 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.56 
 
 
516 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  37.75 
 
 
692 aa  121  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.14 
 
 
486 aa  121  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  32.76 
 
 
519 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  29.43 
 
 
379 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.96 
 
 
566 aa  120  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  32.52 
 
 
397 aa  119  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.5 
 
 
480 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>