More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3932 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  100 
 
 
388 aa  804    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.59 
 
 
572 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  35.96 
 
 
708 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  38.68 
 
 
381 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.41 
 
 
423 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  32.95 
 
 
706 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  32.84 
 
 
474 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  32.84 
 
 
474 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.97 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  31.19 
 
 
391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  34.77 
 
 
366 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  31.84 
 
 
463 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.89 
 
 
467 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.94 
 
 
1004 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.14 
 
 
389 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  31.82 
 
 
462 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.36 
 
 
447 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  30.83 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.41 
 
 
941 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.91 
 
 
384 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  30.62 
 
 
465 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.32 
 
 
385 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  30.8 
 
 
460 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.56 
 
 
447 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  30.86 
 
 
631 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.43 
 
 
396 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0374  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.15 
 
 
471 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.23 
 
 
465 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  34 
 
 
612 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.61 
 
 
995 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  31.13 
 
 
469 aa  135  9e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  34.3 
 
 
642 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1904  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50.41 
 
 
456 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  34.14 
 
 
637 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  34.26 
 
 
455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.03 
 
 
482 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  29.5 
 
 
470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  33.48 
 
 
637 aa  133  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  32.12 
 
 
642 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.95 
 
 
1332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  31.4 
 
 
1079 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  31.7 
 
 
543 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  35.15 
 
 
683 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  33.33 
 
 
443 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.05 
 
 
997 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.03 
 
 
1017 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  28.9 
 
 
474 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.76 
 
 
563 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  30.33 
 
 
1082 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  30.59 
 
 
644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  29.89 
 
 
846 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  32.92 
 
 
754 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  31.06 
 
 
1100 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.87 
 
 
516 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0306  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  53.04 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0689092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  30.86 
 
 
566 aa  127  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.66 
 
 
497 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  31.08 
 
 
1087 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  31.97 
 
 
1083 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  32.92 
 
 
684 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  32.11 
 
 
649 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.74 
 
 
606 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  33.88 
 
 
467 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  35.02 
 
 
853 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
649 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  31.76 
 
 
705 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  28.14 
 
 
464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.71 
 
 
486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  29.92 
 
 
648 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  33.03 
 
 
438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  29.92 
 
 
410 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  31.71 
 
 
472 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  30.74 
 
 
1087 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  33.02 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  27.65 
 
 
381 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.51 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.08 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.31 
 
 
393 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  30.22 
 
 
570 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.31 
 
 
393 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  31.13 
 
 
445 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  27.65 
 
 
378 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  31.2 
 
 
634 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  28.46 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 
453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.45 
 
 
957 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  29.29 
 
 
775 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  31.6 
 
 
445 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  34.3 
 
 
262 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  31.73 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.56 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  29.6 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  31.9 
 
 
716 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.53 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  30.6 
 
 
563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.27 
 
 
602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  29.96 
 
 
630 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.92 
 
 
961 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  30.19 
 
 
687 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>