More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2394 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  94.08 
 
 		 642 aa  1214    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  58.08 
 
 		 637 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  58.27 
 
 		 637 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  59.91 
 
 		 649 aa  749    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 642 aa  1318    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  39.43 
 
 		 853 aa  324  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  39.29 
 
 		 684 aa  293  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  41.38 
 
 		 775 aa  289  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  42.7 
 
 		 410 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  55.69 
 
 		 1100 aa  277  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 		 769 aa  277  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  37.47 
 
 		 754 aa  277  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  35.56 
 
 		 536 aa  271  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  53.15 
 
 		 1079 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 773 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 773 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  49.8 
 
 		 366 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  50.39 
 
 		 1083 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  48.43 
 
 		 1082 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  51.39 
 
 		 1087 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  51 
 
 		 1087 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  29.54 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  32.54 
 
 		 967 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  32.54 
 
 		 967 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  34.55 
 
 		 409 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  28.71 
 
 		 817 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  28.71 
 
 		 817 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.33 
 
 		 654 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 670 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1825  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.04 
 
 		 879 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 726 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.47 
 
 		 765 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.274696 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.78 
 
 		 396 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  29.62 
 
 		 667 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  29.62 
 
 		 670 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.32 
 
 		 751 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  36.88 
 
 		 708 aa  170  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.85 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  35.88 
 
 		 455 aa  163  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  31.69 
 
 		 612 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.96 
 
 		 859 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1246  putative PAS/PAC sensor protein  27.71 
 
 		 508 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  39.13 
 
 		 420 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  29.75 
 
 		 560 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1758  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  35.05 
 
 		 700 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.71 
 
 		 438 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 		 853 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1021  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.69 
 
 		 1051 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126981  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  36.67 
 
 		 706 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  32.56 
 
 		 474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  32.56 
 
 		 474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  35.44 
 
 		 631 aa  157  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  27.72 
 
 		 519 aa  157  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  35.36 
 
 		 1346 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  36.13 
 
 		 687 aa  155  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  36.4 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  34.06 
 
 		 846 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  34.48 
 
 		 465 aa  154  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  31.77 
 
 		 824 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  32.95 
 
 		 477 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  35.2 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.97 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 		 715 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.99155  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.64 
 
 		 465 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.6 
 
 		 423 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2565  two component signal transduction response regulator  40.51 
 
 		 703 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.29 
 
 		 715 aa  150  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  31.23 
 
 		 474 aa  150  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1343  EAL and GGDEF domain-containing protein  33.2 
 
 		 1274 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.4 
 
 		 447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 650 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  32.2 
 
 		 462 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.6 
 
 		 447 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  32.8 
 
 		 447 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34 
 
 		 467 aa  147  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2209  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28 
 
 		 844 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1191  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.1 
 
 		 836 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.668547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  31.76 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.11 
 
 		 994 aa  145  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.8 
 
 		 572 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2055  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.72 
 
 		 1034 aa  145  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 1332 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  34.77 
 
 		 502 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1114  putative diguanylate phosphodiesterase  50.36 
 
 		 568 aa  144  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5218  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  51.08 
 
 		 580 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0126538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  32.55 
 
 		 460 aa  144  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3258  sensory box protein  32.49 
 
 		 1206 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  27.21 
 
 		 840 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 484 aa  143  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3250  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.48 
 
 		 1036 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  28.76 
 
 		 378 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1917  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  38.93 
 
 		 419 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0589316 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 587 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  28.82 
 
 		 516 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1144  signal transduction protein  51.85 
 
 		 571 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.44 
 
 		 962 aa  140  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2305  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.09 
 
 		 935 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0882428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 991 aa  140  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>