More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2520 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  100 
 
 
683 aa  1358    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  41.94 
 
 
486 aa  212  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  38.93 
 
 
705 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  40.22 
 
 
716 aa  200  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  39.27 
 
 
644 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  41.85 
 
 
678 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  39.29 
 
 
648 aa  190  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  43.6 
 
 
634 aa  187  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  40.53 
 
 
706 aa  184  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  35.76 
 
 
379 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  39.25 
 
 
535 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  39.36 
 
 
649 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  44.31 
 
 
645 aa  178  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  41.76 
 
 
705 aa  176  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  36.96 
 
 
708 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  41.42 
 
 
455 aa  174  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  39.27 
 
 
451 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  37.41 
 
 
631 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  34.81 
 
 
413 aa  170  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  37.45 
 
 
687 aa  170  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  35.71 
 
 
543 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.8 
 
 
563 aa  167  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.59 
 
 
590 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.33 
 
 
1004 aa  161  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  37.6 
 
 
451 aa  160  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  40.49 
 
 
657 aa  156  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  37.93 
 
 
453 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  38.85 
 
 
643 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  35.25 
 
 
708 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.72 
 
 
1017 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.45 
 
 
997 aa  151  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.21 
 
 
995 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  35.16 
 
 
459 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  36.43 
 
 
649 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  34.74 
 
 
563 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  36.02 
 
 
438 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  36.65 
 
 
671 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  34.68 
 
 
660 aa  146  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.68 
 
 
1332 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  35.95 
 
 
364 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  33.74 
 
 
443 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 
846 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  36.36 
 
 
1100 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  34.4 
 
 
454 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  32.1 
 
 
366 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  32.53 
 
 
521 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.68 
 
 
957 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  37.6 
 
 
361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  35.08 
 
 
684 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.65 
 
 
480 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  35.94 
 
 
723 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  39 
 
 
1082 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  32.23 
 
 
445 aa  132  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.15 
 
 
388 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  31.25 
 
 
566 aa  131  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  34.67 
 
 
643 aa  130  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.95 
 
 
961 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  32.95 
 
 
637 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  31.31 
 
 
396 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.33 
 
 
792 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  35.44 
 
 
410 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  30.04 
 
 
404 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  34.54 
 
 
472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.27 
 
 
572 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  32.42 
 
 
570 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  31.87 
 
 
445 aa  127  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.15 
 
 
1480 aa  127  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
410 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  35.27 
 
 
378 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  33.2 
 
 
1079 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  35.66 
 
 
365 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  34.57 
 
 
1087 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 
340 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  34.16 
 
 
1087 aa  124  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  35.36 
 
 
853 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  32.57 
 
 
630 aa  123  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.12 
 
 
507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  31.69 
 
 
464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  34.47 
 
 
1083 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  33.73 
 
 
885 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  29.64 
 
 
545 aa  122  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  34.71 
 
 
472 aa  122  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.33 
 
 
526 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  32.09 
 
 
409 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  32.79 
 
 
376 aa  120  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  32.11 
 
 
612 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  32.65 
 
 
397 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 
637 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.6 
 
 
606 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.71 
 
 
389 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  29.23 
 
 
710 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.2 
 
 
748 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  29.59 
 
 
463 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  29.47 
 
 
474 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  32.26 
 
 
754 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  29.89 
 
 
536 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.4 
 
 
497 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  32.13 
 
 
381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  34.02 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>