More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03914 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  100 
 
 		 643 aa  1301    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  31.11 
 
 		 645 aa  256  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  30.6 
 
 		 648 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  31.42 
 
 		 649 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  27.53 
 
 		 644 aa  241  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  30.31 
 
 		 643 aa  237  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  29.86 
 
 		 657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  29.72 
 
 		 716 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  35.56 
 
 		 660 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.91 
 
 		 678 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  27.92 
 
 		 705 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  29.14 
 
 		 705 aa  179  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  35.14 
 
 		 723 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  33.17 
 
 		 634 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  27.35 
 
 		 708 aa  174  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  33.14 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  25.38 
 
 		 706 aa  161  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  25.7 
 
 		 687 aa  161  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.56 
 
 		 486 aa  154  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  36.19 
 
 		 413 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  36.99 
 
 		 451 aa  151  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  31.79 
 
 		 379 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  34.66 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  29.11 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  37.15 
 
 		 671 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.29 
 
 		 563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  34.67 
 
 		 683 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.88 
 
 		 995 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.89 
 
 		 997 aa  127  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  31.04 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  26.86 
 
 		 631 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.3 
 
 		 1017 aa  123  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  31.7 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  34.67 
 
 		 649 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.07 
 
 		 1004 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.58 
 
 		 572 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  32.3 
 
 		 708 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  30.06 
 
 		 710 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  32.8 
 
 		 438 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  30.92 
 
 		 566 aa  113  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  30.22 
 
 		 459 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.34 
 
 		 480 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.69 
 
 		 590 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.45 
 
 		 792 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.55 
 
 		 606 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 		 410 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.35 
 
 		 1332 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  27.24 
 
 		 612 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  29.37 
 
 		 545 aa  106  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  30.2 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.85 
 
 		 748 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.06 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.82 
 
 		 496 aa  103  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  34.27 
 
 		 361 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  28.62 
 
 		 400 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  32.58 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  32.28 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  34.92 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  35.63 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  35.63 
 
 		 431 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  35.63 
 
 		 431 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.6 
 
 		 957 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  31.8 
 
 		 846 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  30.77 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  34.4 
 
 		 365 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.32 
 
 		 1480 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  31.5 
 
 		 637 aa  99.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 		 364 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  28.63 
 
 		 341 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  24.74 
 
 		 785 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  27.92 
 
 		 885 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  26.94 
 
 		 684 aa  97.8  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  22.72 
 
 		 705 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  29.88 
 
 		 443 aa  97.4  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.47 
 
 		 516 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  27.98 
 
 		 754 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  30.77 
 
 		 502 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  29.38 
 
 		 533 aa  97.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  29.04 
 
 		 477 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.57 
 
 		 482 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  30.31 
 
 		 840 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  30.59 
 
 		 570 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.52 
 
 		 465 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  28.8 
 
 		 637 aa  95.5  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  30.49 
 
 		 1100 aa  94.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.08 
 
 		 507 aa  94.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.15 
 
 		 497 aa  94.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  24.7 
 
 		 404 aa  94.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.48 
 
 		 1087 aa  94.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.77 
 
 		 526 aa  94  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  30.19 
 
 		 630 aa  94.4  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  29.58 
 
 		 467 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  28.74 
 
 		 340 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  30.8 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  31.94 
 
 		 472 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  27.36 
 
 		 682 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  25.54 
 
 		 633 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  27.18 
 
 		 465 aa  92  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>