More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1793 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  100 
 
 		 486 aa  987    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  42.7 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 451 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  50 
 
 		 705 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  47.13 
 
 		 648 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  35.76 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  47.81 
 
 		 644 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  44.27 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  45.45 
 
 		 716 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  49.6 
 
 		 649 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  45.82 
 
 		 543 aa  227  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  45.93 
 
 		 535 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  46.39 
 
 		 657 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  45.83 
 
 		 643 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  45.31 
 
 		 634 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  48.85 
 
 		 645 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  41.94 
 
 		 683 aa  212  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  40.61 
 
 		 705 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  42.97 
 
 		 678 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  38.35 
 
 		 708 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  38.62 
 
 		 413 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  41.51 
 
 		 723 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.82 
 
 		 563 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  40.73 
 
 		 708 aa  172  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  41.04 
 
 		 631 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  36.68 
 
 		 706 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  38.87 
 
 		 671 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  40.32 
 
 		 660 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.27 
 
 		 590 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.31 
 
 		 1004 aa  157  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.97 
 
 		 572 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  35.77 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  34.72 
 
 		 643 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.13 
 
 		 1017 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 		 361 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  37.31 
 
 		 687 aa  151  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.59 
 
 		 606 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  37.05 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  34.51 
 
 		 566 aa  150  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  34.21 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  29.88 
 
 		 340 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  35.4 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  30.85 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  33.33 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  33.07 
 
 		 445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  34.13 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  35.74 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.12 
 
 		 995 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 570 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  37.5 
 
 		 558 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  34.63 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  35.2 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  36.98 
 
 		 572 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  34.68 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  30.28 
 
 		 577 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  32.31 
 
 		 1079 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  36.98 
 
 		 572 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.48 
 
 		 507 aa  136  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  38.78 
 
 		 556 aa  136  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  36.68 
 
 		 578 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.14 
 
 		 961 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  36 
 
 		 572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.71 
 
 		 792 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  33.46 
 
 		 563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.25 
 
 		 997 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.36 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.51 
 
 		 957 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  38.78 
 
 		 556 aa  134  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  30.99 
 
 		 404 aa  134  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  31.66 
 
 		 846 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  32.79 
 
 		 754 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  31.48 
 
 		 1082 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.73 
 
 		 1087 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.52 
 
 		 480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  34.51 
 
 		 378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  31.01 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  34.44 
 
 		 1100 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.2 
 
 		 389 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  35.45 
 
 		 564 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  29.89 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  31.39 
 
 		 377 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  33.33 
 
 		 650 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  33.93 
 
 		 575 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  32.57 
 
 		 630 aa  127  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  29.96 
 
 		 1087 aa  126  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  31.84 
 
 		 649 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  30.3 
 
 		 1083 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  33.2 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.92 
 
 		 1480 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  36.79 
 
 		 567 aa  124  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.2 
 
 		 748 aa  123  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  34.16 
 
 		 576 aa  123  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.42 
 
 		 447 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  30.45 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  33.08 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  30.42 
 
 		 474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  30.07 
 
 		 775 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  30.97 
 
 		 637 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  30.62 
 
 		 391 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.71 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>