More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2204 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  100 
 
 
644 aa  1311    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  45.16 
 
 
648 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  44.91 
 
 
645 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  45.48 
 
 
643 aa  532  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  45.95 
 
 
657 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  43.44 
 
 
649 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  35.14 
 
 
705 aa  334  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  34.22 
 
 
716 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  34.93 
 
 
705 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  33.78 
 
 
708 aa  262  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  36.04 
 
 
535 aa  239  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  31.64 
 
 
706 aa  239  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  37.07 
 
 
634 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  47.81 
 
 
486 aa  239  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.69 
 
 
678 aa  238  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  31.66 
 
 
687 aa  232  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  37.71 
 
 
660 aa  228  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  37.43 
 
 
543 aa  223  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  29.29 
 
 
643 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  38.44 
 
 
723 aa  220  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  38.41 
 
 
379 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  38.11 
 
 
683 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  36.13 
 
 
631 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  38.87 
 
 
413 aa  184  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  40.96 
 
 
451 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  41.63 
 
 
455 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.48 
 
 
563 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  37.26 
 
 
708 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.66 
 
 
995 aa  167  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  34.5 
 
 
521 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.48 
 
 
1004 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.04 
 
 
997 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  32.95 
 
 
566 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.83 
 
 
1017 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  33.82 
 
 
453 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  31.87 
 
 
451 aa  152  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.46 
 
 
606 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  38.21 
 
 
671 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  36.84 
 
 
472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  36.92 
 
 
365 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.91 
 
 
590 aa  144  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.06 
 
 
572 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  34.56 
 
 
612 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 
361 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  34.02 
 
 
340 aa  141  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  35.74 
 
 
443 aa  140  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.89 
 
 
1332 aa  140  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  37.5 
 
 
438 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  32.54 
 
 
366 aa  140  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  33.6 
 
 
364 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  34.96 
 
 
1087 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  34.29 
 
 
1087 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  33.1 
 
 
570 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  28.47 
 
 
1079 aa  136  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  24.54 
 
 
705 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  25.48 
 
 
885 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.46 
 
 
748 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  33.73 
 
 
1100 aa  134  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  31.77 
 
 
459 aa  133  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.14 
 
 
957 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  31.67 
 
 
409 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  29.63 
 
 
474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.93 
 
 
507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  29.63 
 
 
474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  34.05 
 
 
846 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  34.13 
 
 
445 aa  131  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.91 
 
 
423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.63 
 
 
480 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.02 
 
 
385 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  31.65 
 
 
649 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  31.1 
 
 
637 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.59 
 
 
388 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  30.51 
 
 
477 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.63 
 
 
410 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  28.49 
 
 
710 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  29.89 
 
 
637 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.37 
 
 
1480 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  29.87 
 
 
1082 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  24.78 
 
 
650 aa  127  7e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  32.65 
 
 
381 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  30.91 
 
 
474 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  32.41 
 
 
445 aa  126  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.28 
 
 
961 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 
377 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.07 
 
 
447 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  29.52 
 
 
463 aa  125  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.73 
 
 
447 aa  124  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.78 
 
 
467 aa  124  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  32.78 
 
 
467 aa  123  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  34.8 
 
 
469 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  29.74 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  34.06 
 
 
470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.92 
 
 
823 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.79 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 
545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.92 
 
 
497 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  30.04 
 
 
642 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  30.2 
 
 
536 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>