More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4557 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  100 
 
 
606 aa  1240    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  30.36 
 
 
566 aa  231  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  26.81 
 
 
630 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  30.17 
 
 
438 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  33.33 
 
 
612 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.25 
 
 
423 aa  154  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  33.94 
 
 
644 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.59 
 
 
486 aa  151  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  33.83 
 
 
379 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.46 
 
 
563 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  32.32 
 
 
705 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  35.32 
 
 
649 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.56 
 
 
748 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  33.07 
 
 
413 aa  140  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  34.72 
 
 
631 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  33.72 
 
 
451 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  35.12 
 
 
443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.63 
 
 
590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.6 
 
 
497 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  33.33 
 
 
543 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  30.04 
 
 
706 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  30.23 
 
 
1087 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  29.63 
 
 
366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  30.07 
 
 
1087 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.4 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  31.23 
 
 
1082 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  33.65 
 
 
557 aa  134  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  30.71 
 
 
637 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.66 
 
 
507 aa  134  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.38 
 
 
995 aa  133  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  32.11 
 
 
708 aa  133  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.09 
 
 
572 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  30.15 
 
 
716 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  32.66 
 
 
687 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  31.64 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  28.97 
 
 
474 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  28.97 
 
 
474 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.37 
 
 
1480 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  30.09 
 
 
455 aa  130  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  34.43 
 
 
381 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  33.22 
 
 
445 aa  128  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  29.34 
 
 
648 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  28.86 
 
 
1083 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  32.22 
 
 
400 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  32.46 
 
 
557 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.05 
 
 
1017 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.02 
 
 
388 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.18 
 
 
961 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  29.38 
 
 
470 aa  124  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  32.55 
 
 
445 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  26.05 
 
 
584 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  31.18 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.8 
 
 
957 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.5 
 
 
1004 aa  122  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  29.54 
 
 
1100 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  30.51 
 
 
634 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.6 
 
 
997 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  29.64 
 
 
649 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  33.72 
 
 
683 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  29.02 
 
 
410 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  29.66 
 
 
846 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  28.96 
 
 
1079 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  29.08 
 
 
705 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  32.39 
 
 
637 aa  117  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  27.43 
 
 
474 aa  117  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 
642 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  29.89 
 
 
657 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  28.53 
 
 
462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.31 
 
 
467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  30.42 
 
 
535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.87 
 
 
482 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  29.63 
 
 
723 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  24.38 
 
 
533 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  25.23 
 
 
460 aa  113  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.38 
 
 
1332 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  30.48 
 
 
645 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  30.38 
 
 
643 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  31.45 
 
 
642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  31.1 
 
 
340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  25.46 
 
 
463 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  28.16 
 
 
581 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  31.62 
 
 
453 aa  111  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.57 
 
 
678 aa  111  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  29.48 
 
 
472 aa  110  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  32.95 
 
 
451 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.48 
 
 
792 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  29.02 
 
 
643 aa  110  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  29.55 
 
 
519 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  26.07 
 
 
477 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  27.94 
 
 
660 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  30.99 
 
 
754 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  30.31 
 
 
467 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  30.89 
 
 
409 aa  108  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.65 
 
 
465 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  27.65 
 
 
465 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  25.16 
 
 
459 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  25.13 
 
 
429 aa  107  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  28.93 
 
 
775 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.8 
 
 
847 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.71 
 
 
447 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>