More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0662 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  100 
 
 
557 aa  1154    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  60.14 
 
 
553 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  74.01 
 
 
557 aa  833    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  47.14 
 
 
1180 aa  301  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  51.12 
 
 
1156 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  46.08 
 
 
1172 aa  269  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  45.95 
 
 
315 aa  263  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  46.08 
 
 
317 aa  248  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  43.67 
 
 
312 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.3 
 
 
572 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  25.05 
 
 
543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3395  response regulator receiver protein  54.69 
 
 
132 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.306635  normal  0.186564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  31.51 
 
 
465 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.82 
 
 
467 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.82 
 
 
465 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  25.09 
 
 
560 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  35 
 
 
521 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.18 
 
 
497 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.43 
 
 
507 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.19 
 
 
1332 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.75 
 
 
1480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.88 
 
 
957 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.25 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  33.47 
 
 
463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  29.62 
 
 
366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.82 
 
 
961 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  33.74 
 
 
460 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  30.42 
 
 
469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.28 
 
 
389 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1021  putative PAS/PAC sensor protein  23.13 
 
 
564 aa  130  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  30.06 
 
 
477 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  29.3 
 
 
470 aa  127  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  27.78 
 
 
438 aa  127  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  41.45 
 
 
154 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.46 
 
 
606 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  37.81 
 
 
708 aa  125  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  28.92 
 
 
474 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  28.92 
 
 
474 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.09 
 
 
563 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  28.53 
 
 
566 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  32.95 
 
 
391 aa  123  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  28.71 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  24.73 
 
 
516 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.97 
 
 
480 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  36.5 
 
 
644 aa  120  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  32.34 
 
 
1082 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.24 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.18 
 
 
423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  33.6 
 
 
455 aa  118  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  45.31 
 
 
447 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  29.73 
 
 
474 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1404  response regulator receiver protein  42.54 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.54 
 
 
391 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  24.5 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  45.6 
 
 
151 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.72 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  42.98 
 
 
359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  37.11 
 
 
1087 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  31.78 
 
 
379 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  32.21 
 
 
649 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  32.24 
 
 
447 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  34.65 
 
 
376 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  35.82 
 
 
706 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35 
 
 
941 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.6 
 
 
447 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  25.6 
 
 
630 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  37.11 
 
 
1087 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  43.45 
 
 
476 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
649 aa  113  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  35.86 
 
 
705 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.13 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 
642 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  26.43 
 
 
1100 aa  112  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.51 
 
 
452 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.33 
 
 
486 aa  112  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2808  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.89 
 
 
482 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  32.66 
 
 
631 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.55 
 
 
1355 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2388  response regulator receiver protein  39.84 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.319662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  43.22 
 
 
303 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  38.31 
 
 
853 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  36.17 
 
 
381 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1912  cyclic nucleotide-binding protein  41.86 
 
 
590 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0713503  normal  0.243299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  32.68 
 
 
684 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
365 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  31.3 
 
 
459 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 
413 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  33.18 
 
 
637 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06147  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  42.86 
 
 
549 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.44 
 
 
994 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
1465 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1161  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.09 
 
 
496 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.175427  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01019  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  42.86 
 
 
549 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.159296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2273  putative two-component response regulator  43.22 
 
 
304 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.438912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  37.76 
 
 
270 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  39.89 
 
 
642 aa  108  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  27.65 
 
 
443 aa  108  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  35.1 
 
 
705 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.7 
 
 
629 aa  107  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.69 
 
 
469 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>