More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1021 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1021  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 564 aa  1154    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  54.86 
 
 		 560 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  56.19 
 
 		 543 aa  641    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1360  putative PAS/PAC sensor protein  48.69 
 
 		 536 aa  528  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1789  response regulator receiver protein  53.54 
 
 		 142 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  26.84 
 
 		 410 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  24.37 
 
 		 684 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  23.13 
 
 		 557 aa  130  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  29.65 
 
 		 965 aa  124  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  23.6 
 
 		 557 aa  123  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  28.75 
 
 		 649 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1465 aa  117  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  24.23 
 
 		 513 aa  113  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  26.89 
 
 		 1100 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.81 
 
 		 1355 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  21.68 
 
 		 536 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  35.8 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  25.37 
 
 		 1079 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  25.26 
 
 		 775 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  26.44 
 
 		 706 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 270 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  39.04 
 
 		 262 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  25.34 
 
 		 637 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  34.54 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  25.81 
 
 		 366 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  27.18 
 
 		 708 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2363  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 189 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.69 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.36 
 
 		 317 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  23.32 
 
 		 642 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  34.78 
 
 		 439 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  34.78 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  34.78 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  24.32 
 
 		 409 aa  100  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  34.78 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  34.78 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  34.78 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.5 
 
 		 629 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  34.78 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  24.9 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  33.8 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.9 
 
 		 452 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  31.01 
 
 		 434 aa  98.6  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  35.33 
 
 		 285 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 363 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  34.57 
 
 		 456 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.62 
 
 		 994 aa  97.8  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06147  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  37.3 
 
 		 549 aa  97.8  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015374  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  34.06 
 
 		 484 aa  97.8  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01019  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  37.3 
 
 		 549 aa  97.8  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.159296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1538  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 		 563 aa  97.4  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2367  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 538 aa  96.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  31.69 
 
 		 438 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  38.76 
 
 		 1180 aa  96.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  32.3 
 
 		 315 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.55 
 
 		 507 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1912  cyclic nucleotide-binding protein  36.13 
 
 		 590 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0713503  normal  0.243299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.7 
 
 		 572 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 		 469 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 		 469 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  32.64 
 
 		 475 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  32.64 
 
 		 475 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2388  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 154 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.319662 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  32.64 
 
 		 475 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  32.64 
 
 		 475 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  32.64 
 
 		 475 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  32.64 
 
 		 518 aa  94.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  26.16 
 
 		 1083 aa  94  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  32.64 
 
 		 475 aa  94.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  34.07 
 
 		 312 aa  94  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  34.04 
 
 		 154 aa  93.6  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  26.64 
 
 		 631 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  25.31 
 
 		 362 aa  93.2  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3257  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 		 358 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2539  response regulator  37.82 
 
 		 658 aa  92.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 		 444 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.87 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  33.33 
 
 		 1111 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  37.69 
 
 		 1156 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1895  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 185 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.706146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  32.89 
 
 		 823 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  31.69 
 
 		 359 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  23.31 
 
 		 642 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  23.65 
 
 		 637 aa  91.3  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  32.41 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  20.81 
 
 		 754 aa  91.3  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  26.27 
 
 		 781 aa  91.7  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3805  response regulator receiver domain-containing protein  26.71 
 
 		 439 aa  91.3  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2012  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 484 aa  91.3  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 365 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 		 472 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 		 472 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  39.45 
 
 		 303 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 520 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3800  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 488 aa  90.1  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  23.33 
 
 		 853 aa  89.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 516 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>