More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0916 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 781 aa  1585    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  34.15 
 
 		 642 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  32.53 
 
 		 366 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  33.03 
 
 		 642 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  31.97 
 
 		 708 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  31.5 
 
 		 612 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  28.52 
 
 		 472 aa  111  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  28.49 
 
 		 469 aa  110  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  27.17 
 
 		 631 aa  108  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.78 
 
 		 1051 aa  108  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.61 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  31.43 
 
 		 1100 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  34.26 
 
 		 488 aa  107  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.97 
 
 		 563 aa  107  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  25.08 
 
 		 743 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  31.53 
 
 		 716 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.3 
 
 		 507 aa  106  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.14 
 
 		 486 aa  105  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  34.39 
 
 		 637 aa  104  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  33.94 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  32.74 
 
 		 379 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  34.88 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  32.24 
 
 		 657 aa  102  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.28 
 
 		 728 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  28.15 
 
 		 706 aa  101  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  29.91 
 
 		 648 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  34.17 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  32.05 
 
 		 465 aa  101  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  32.26 
 
 		 404 aa  101  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  31.08 
 
 		 391 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.05 
 
 		 465 aa  101  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.43 
 
 		 400 aa  101  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  31.78 
 
 		 643 aa  101  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 377 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  33.5 
 
 		 644 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 		 658 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.64 
 
 		 997 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  28.52 
 
 		 462 aa  99  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.95 
 
 		 423 aa  99  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  28.93 
 
 		 543 aa  98.6  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.69 
 
 		 411 aa  98.6  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  36.57 
 
 		 262 aa  98.2  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  29.26 
 
 		 362 aa  98.2  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  29.12 
 
 		 688 aa  98.2  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2742  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30 
 
 		 438 aa  97.8  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0101851  normal  0.919668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.51 
 
 		 384 aa  97.8  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.84 
 
 		 549 aa  97.8  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.22 
 
 		 572 aa  97.4  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  28.89 
 
 		 705 aa  97.4  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  30.56 
 
 		 415 aa  97.4  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  30.62 
 
 		 396 aa  97.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  30.46 
 
 		 574 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  31.4 
 
 		 846 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.97 
 
 		 847 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  28.46 
 
 		 453 aa  97.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  27.62 
 
 		 775 aa  97.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.3 
 
 		 447 aa  97.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  32.1 
 
 		 1017 aa  96.3  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  33.33 
 
 		 753 aa  96.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.42 
 
 		 385 aa  96.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  31.98 
 
 		 649 aa  96.3  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.81 
 
 		 388 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.22 
 
 		 532 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  32.43 
 
 		 1087 aa  96.3  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  30.29 
 
 		 581 aa  96.3  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  29.41 
 
 		 693 aa  96.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  32.47 
 
 		 1087 aa  95.5  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 		 410 aa  95.5  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  29.03 
 
 		 447 aa  95.5  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  30.73 
 
 		 443 aa  94.7  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.87 
 
 		 678 aa  95.1  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  35.54 
 
 		 723 aa  94.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.78 
 
 		 590 aa  94.7  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  28 
 
 		 438 aa  94.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  30.43 
 
 		 451 aa  94  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  27.35 
 
 		 404 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.73 
 
 		 606 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.48 
 
 		 523 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  28.08 
 
 		 637 aa  93.2  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2643  putative PAS/PAC sensor protein  31.93 
 
 		 456 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.51 
 
 		 482 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.69 
 
 		 560 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  29.55 
 
 		 694 aa  92.8  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.84 
 
 		 447 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  24.29 
 
 		 543 aa  92.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 1711 aa  92.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  29.95 
 
 		 634 aa  91.7  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  25.61 
 
 		 413 aa  92  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1021  putative PAS/PAC sensor protein  26.27 
 
 		 564 aa  91.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  33.5 
 
 		 649 aa  91.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.76 
 
 		 684 aa  90.9  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.58 
 
 		 445 aa  90.9  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 393 aa  90.9  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  32.82 
 
 		 467 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 393 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 393 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 		 519 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  24.85 
 
 		 744 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  31.07 
 
 		 705 aa  90.1  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  29.36 
 
 		 474 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>