More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2062 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  100 
 
 
366 aa  747    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  48.67 
 
 
1079 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  49.07 
 
 
1100 aa  362  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  47.07 
 
 
1087 aa  338  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  46.67 
 
 
1087 aa  336  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  46.42 
 
 
1082 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  45.92 
 
 
1083 aa  292  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  52.57 
 
 
410 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  48.02 
 
 
637 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  51.61 
 
 
649 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  41.05 
 
 
853 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  49.8 
 
 
642 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  50.2 
 
 
642 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  48.15 
 
 
684 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  46.84 
 
 
775 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  44.12 
 
 
536 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  47.67 
 
 
637 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  39.32 
 
 
754 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  34.37 
 
 
474 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  34.37 
 
 
474 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  38.39 
 
 
469 aa  192  9e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.86 
 
 
396 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  38.85 
 
 
708 aa  189  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  35.9 
 
 
465 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  33.12 
 
 
477 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  36.24 
 
 
470 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.62 
 
 
563 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  33.87 
 
 
474 aa  186  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  34.41 
 
 
463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.26 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  34.29 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.01 
 
 
572 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.77 
 
 
467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  36.72 
 
 
455 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.95 
 
 
482 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.2 
 
 
1332 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.79 
 
 
957 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  32.08 
 
 
462 aa  177  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.13 
 
 
961 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  35.71 
 
 
706 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.72 
 
 
447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  34.77 
 
 
631 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  33.68 
 
 
612 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  36.58 
 
 
447 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.78 
 
 
423 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.65 
 
 
1480 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  33.72 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.23 
 
 
507 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  33.67 
 
 
429 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.95 
 
 
1004 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  34.4 
 
 
687 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  36.14 
 
 
716 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  37.65 
 
 
846 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  30.03 
 
 
423 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  40.16 
 
 
649 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  34.75 
 
 
521 aa  155  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  32.44 
 
 
584 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  38.11 
 
 
376 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.83 
 
 
997 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  35.95 
 
 
364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  34.72 
 
 
543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.05 
 
 
590 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.65 
 
 
497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  36.11 
 
 
361 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  33.8 
 
 
705 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  35.12 
 
 
705 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  35.68 
 
 
472 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.77 
 
 
388 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.33 
 
 
1017 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 
400 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.4 
 
 
486 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  33.33 
 
 
381 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  35.89 
 
 
648 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  36.51 
 
 
365 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  32.05 
 
 
683 aa  142  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  30.57 
 
 
630 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  33.21 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.1 
 
 
480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  30.89 
 
 
570 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  32.7 
 
 
413 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.48 
 
 
748 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34 
 
 
995 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  32.54 
 
 
644 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  34.25 
 
 
502 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  32.29 
 
 
445 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.26 
 
 
678 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  35.39 
 
 
634 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0346  protein serine/threonine phosphatase  32.31 
 
 
479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  28.2 
 
 
438 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  32.1 
 
 
683 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.63 
 
 
606 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  32.99 
 
 
643 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  32.99 
 
 
657 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  29.25 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  32.4 
 
 
885 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.37 
 
 
384 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  29.62 
 
 
557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  32.81 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  32.54 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>