More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0721 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  100 
 
 
885 aa  1815    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  38.32 
 
 
502 aa  212  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  26.53 
 
 
706 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  27.45 
 
 
708 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0346  protein serine/threonine phosphatase  41.2 
 
 
479 aa  201  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  26.64 
 
 
716 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  25.98 
 
 
687 aa  177  8e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  25.82 
 
 
705 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.15 
 
 
563 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  35.58 
 
 
455 aa  154  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  28.01 
 
 
657 aa  154  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  23.64 
 
 
705 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  32.35 
 
 
631 aa  152  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  25 
 
 
678 aa  148  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  28.07 
 
 
643 aa  147  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  33.05 
 
 
754 aa  145  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  32.93 
 
 
637 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.51 
 
 
997 aa  141  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.69 
 
 
995 aa  141  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.87 
 
 
482 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  28.48 
 
 
650 aa  137  7.000000000000001e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  33.47 
 
 
443 aa  137  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  25.7 
 
 
648 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  34.8 
 
 
642 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.81 
 
 
423 aa  135  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  25.48 
 
 
644 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  31.94 
 
 
1100 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.51 
 
 
572 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  33.72 
 
 
612 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  32.4 
 
 
366 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  33.45 
 
 
642 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  32.79 
 
 
464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  29.21 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  29.56 
 
 
477 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  29.01 
 
 
413 aa  131  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  32.3 
 
 
465 aa  130  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.3 
 
 
465 aa  130  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.62 
 
 
423 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  31.73 
 
 
1087 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  30.55 
 
 
570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  32.13 
 
 
1087 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.62 
 
 
447 aa  129  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  34.73 
 
 
649 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  32.05 
 
 
469 aa  127  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  30.98 
 
 
1083 aa  127  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  29.23 
 
 
447 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  27.04 
 
 
645 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  29.1 
 
 
463 aa  125  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.23 
 
 
480 aa  125  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.85 
 
 
447 aa  125  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  30.04 
 
 
429 aa  124  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.35 
 
 
507 aa  124  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  30.97 
 
 
470 aa  124  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.33 
 
 
1004 aa  124  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.3 
 
 
1480 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.23 
 
 
467 aa  124  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  31.89 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  28.87 
 
 
649 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  26.79 
 
 
474 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  33.73 
 
 
683 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  29.66 
 
 
462 aa  120  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.32 
 
 
1017 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  31.8 
 
 
630 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  28.7 
 
 
660 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  27.88 
 
 
1082 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  31.64 
 
 
637 aa  119  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  31.56 
 
 
684 aa  119  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  28.23 
 
 
1079 aa  119  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  27.9 
 
 
474 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  27.9 
 
 
474 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.74 
 
 
590 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  32.38 
 
 
630 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  30.95 
 
 
445 aa  118  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  32.38 
 
 
630 aa  118  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.96 
 
 
410 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.1 
 
 
486 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  32.06 
 
 
630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  30.27 
 
 
563 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  23.97 
 
 
543 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  29.53 
 
 
566 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
361 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  30.56 
 
 
445 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  30.3 
 
 
723 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  26.97 
 
 
521 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.23 
 
 
957 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  26.5 
 
 
786 aa  114  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  27.69 
 
 
633 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  24.36 
 
 
785 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  30.74 
 
 
853 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  28.4 
 
 
381 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  30.08 
 
 
376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  31.3 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  28.69 
 
 
536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.92 
 
 
497 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1680  sigma factor B regulator protein  27.17 
 
 
333 aa  112  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  29.41 
 
 
535 aa  111  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 
410 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  33.47 
 
 
365 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  29.58 
 
 
521 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  30.36 
 
 
364 aa  108  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>