More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1596 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  100 
 
 		 521 aa  1050    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  55.29 
 
 		 663 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  51.87 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  51.87 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  53.48 
 
 		 378 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  49.1 
 
 		 840 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  49.66 
 
 		 682 aa  276  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  51.53 
 
 		 670 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  51.53 
 
 		 667 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  52.65 
 
 		 705 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  48.38 
 
 		 967 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  48.38 
 
 		 967 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  48.04 
 
 		 817 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  48.04 
 
 		 817 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2571  protein serine/threonine phosphatase  48.22 
 
 		 251 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 		 785 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  42.31 
 
 		 786 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  45.04 
 
 		 786 aa  207  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  37.02 
 
 		 556 aa  203  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1473  protein serine/threonine phosphatase  29.31 
 
 		 558 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  29.57 
 
 		 649 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  30.7 
 
 		 630 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  30.7 
 
 		 630 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  31.86 
 
 		 630 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  30.9 
 
 		 687 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  33.91 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  28.18 
 
 		 642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  28.46 
 
 		 642 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  30.59 
 
 		 633 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.32 
 
 		 480 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.94 
 
 		 572 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  31.72 
 
 		 1087 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.01 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.4 
 
 		 708 aa  110  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  29.07 
 
 		 631 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  30.22 
 
 		 1087 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  29.93 
 
 		 754 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  29.51 
 
 		 885 aa  108  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  30.12 
 
 		 1100 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  28.68 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  28.78 
 
 		 1082 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  27.15 
 
 		 637 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  27.06 
 
 		 381 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  28.09 
 
 		 1079 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  28.85 
 
 		 566 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  29.5 
 
 		 649 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  31.99 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 		 787 aa  103  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.97 
 
 		 957 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.82 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.27 
 
 		 1332 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  26.26 
 
 		 705 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.77 
 
 		 678 aa  100  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  28.97 
 
 		 1083 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 536 aa  100  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  27.4 
 
 		 637 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  26.85 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  25.54 
 
 		 644 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  31.17 
 
 		 502 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  24.58 
 
 		 521 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  30.26 
 
 		 846 aa  98.6  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  26.49 
 
 		 785 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.79 
 
 		 1017 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.13 
 
 		 692 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.12 
 
 		 995 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.08 
 
 		 1480 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.3 
 
 		 507 aa  96.7  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.93 
 
 		 563 aa  96.7  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  29.31 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  27.41 
 
 		 775 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.03 
 
 		 590 aa  95.5  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.76 
 
 		 1004 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.79 
 
 		 606 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  26.59 
 
 		 785 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  28.19 
 
 		 464 aa  94  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  28.25 
 
 		 708 aa  94  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.73 
 
 		 961 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1123  sigma factor regulatory protein, putative  27.41 
 
 		 561 aa  93.6  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  29.71 
 
 		 474 aa  93.6  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.35 
 
 		 997 aa  93.6  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  26.46 
 
 		 630 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  23.37 
 
 		 706 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.81 
 
 		 497 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  29.47 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0020  stage II sporulation E family protein  28.12 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.09 
 
 		 482 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  27.03 
 
 		 634 aa  91.3  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4938  putative lipoprotein  27.52 
 
 		 686 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  29.62 
 
 		 612 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  27.86 
 
 		 445 aa  89.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  26.97 
 
 		 785 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.3 
 
 		 388 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  27.82 
 
 		 800 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0980  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.46 
 
 		 683 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403216 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  26.85 
 
 		 443 aa  88.6  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  26.98 
 
 		 474 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  26.98 
 
 		 474 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  23.18 
 
 		 705 aa  87.8  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.02 
 
 		 684 aa  87.4  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>