More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0093 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 464 aa  938    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  42.93 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  31.94 
 
 		 445 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  32.46 
 
 		 445 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.63 
 
 		 572 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  32.36 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  31.94 
 
 		 612 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.31 
 
 		 1332 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  34.29 
 
 		 708 aa  153  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.08 
 
 		 590 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.83 
 
 		 961 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.85 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  34.15 
 
 		 455 aa  143  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  34.29 
 
 		 631 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  32.65 
 
 		 364 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.85 
 
 		 1004 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.82 
 
 		 563 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.11 
 
 		 957 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  35.12 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  27.09 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.7 
 
 		 1480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.84 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  34.15 
 
 		 687 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  30.86 
 
 		 706 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.07 
 
 		 748 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.67 
 
 		 1017 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  32.79 
 
 		 885 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  30.66 
 
 		 429 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  34.03 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  33.07 
 
 		 443 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  27.51 
 
 		 1079 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  28.75 
 
 		 584 aa  127  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  31.58 
 
 		 1100 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  28.87 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  29.88 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  28.3 
 
 		 642 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  28.9 
 
 		 366 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.97 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  27.15 
 
 		 637 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  27.34 
 
 		 649 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  30.27 
 
 		 502 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  27.33 
 
 		 566 aa  123  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  31.98 
 
 		 648 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  29.03 
 
 		 1083 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  31.69 
 
 		 683 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.14 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  26.97 
 
 		 642 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  32.07 
 
 		 365 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  28.36 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  31.66 
 
 		 570 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  30.49 
 
 		 340 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.64 
 
 		 995 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  29.61 
 
 		 683 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  29.8 
 
 		 1087 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  32.39 
 
 		 643 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.8 
 
 		 1087 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  29.03 
 
 		 637 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.04 
 
 		 792 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  30.1 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.32 
 
 		 486 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  31.98 
 
 		 657 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  28.63 
 
 		 1082 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  34.38 
 
 		 563 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  30.91 
 
 		 708 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  32 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  30.96 
 
 		 467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  27.35 
 
 		 413 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  28.11 
 
 		 775 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.04 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 		 716 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  29.83 
 
 		 754 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.2 
 
 		 678 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.67 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  28.08 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  30.3 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  29.62 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  27.39 
 
 		 721 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  28.25 
 
 		 644 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  30.92 
 
 		 649 aa  109  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  24.84 
 
 		 630 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  28.52 
 
 		 463 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  29.28 
 
 		 379 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  29.71 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  29.57 
 
 		 470 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  31.64 
 
 		 705 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  28.97 
 
 		 460 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  25.89 
 
 		 533 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  29.64 
 
 		 535 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0672  RsbU-like serine phosphatase, regulator of sigma subunit  28.63 
 
 		 254 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.69 
 
 		 602 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  27.8 
 
 		 474 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.89 
 
 		 385 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2141  stage II sporulation E family protein  30.95 
 
 		 333 aa  106  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2104  stage II sporulation E family protein  30.95 
 
 		 333 aa  106  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799939  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.5 
 
 		 606 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 		 705 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  29.71 
 
 		 262 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.23 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>