More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3680 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  70.57 
 
 		 785 aa  1117    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  69.86 
 
 		 786 aa  1087    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 786 aa  1595    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  36.77 
 
 		 705 aa  313  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  46.45 
 
 		 817 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  46.45 
 
 		 817 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  45.78 
 
 		 670 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  45.78 
 
 		 667 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  48.67 
 
 		 840 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  48.57 
 
 		 967 aa  287  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  48.57 
 
 		 967 aa  287  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  53.33 
 
 		 393 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  53.33 
 
 		 393 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  54.12 
 
 		 378 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  44.3 
 
 		 682 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  42.5 
 
 		 663 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2571  protein serine/threonine phosphatase  48.56 
 
 		 251 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  45.04 
 
 		 521 aa  221  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  24.4 
 
 		 705 aa  144  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  30.31 
 
 		 630 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  30.31 
 
 		 630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  30.31 
 
 		 630 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  24.06 
 
 		 708 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  22.73 
 
 		 705 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  23.8 
 
 		 706 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  29.06 
 
 		 633 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  30.51 
 
 		 543 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  24.68 
 
 		 649 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  26.67 
 
 		 885 aa  121  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  25.12 
 
 		 716 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  29.46 
 
 		 687 aa  119  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  24.24 
 
 		 644 aa  119  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  24.26 
 
 		 648 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  30.04 
 
 		 1100 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.45 
 
 		 480 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  30.83 
 
 		 853 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  31.23 
 
 		 1087 aa  114  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  31.64 
 
 		 649 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.82 
 
 		 957 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  31 
 
 		 463 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  31.3 
 
 		 366 aa  112  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  30.1 
 
 		 462 aa  111  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  30.43 
 
 		 1087 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0020  stage II sporulation E family protein  31.6 
 
 		 464 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 536 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.44 
 
 		 961 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.7 
 
 		 1332 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.62 
 
 		 748 aa  108  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.43 
 
 		 482 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  27.67 
 
 		 1079 aa  108  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  31.54 
 
 		 413 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  32.95 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  31.23 
 
 		 477 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  27.07 
 
 		 637 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  28.02 
 
 		 642 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  28.9 
 
 		 474 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.96 
 
 		 684 aa  105  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  28.9 
 
 		 474 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  27.63 
 
 		 642 aa  104  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  29.77 
 
 		 460 aa  104  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  28.12 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  29.19 
 
 		 474 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  32.68 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  28.35 
 
 		 410 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  28.12 
 
 		 723 aa  102  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  25.35 
 
 		 645 aa  101  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  27.64 
 
 		 661 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  27.01 
 
 		 521 aa  101  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  31.58 
 
 		 846 aa  100  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  30.74 
 
 		 637 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.68 
 
 		 572 aa  99.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.55 
 
 		 467 aa  99.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  29.56 
 
 		 465 aa  98.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  28.9 
 
 		 469 aa  98.6  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  29.77 
 
 		 470 aa  98.6  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  26.91 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.76 
 
 		 516 aa  97.8  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  27.16 
 
 		 710 aa  97.8  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  27.8 
 
 		 1083 aa  97.8  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  26.91 
 
 		 663 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.84 
 
 		 590 aa  96.3  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.2 
 
 		 465 aa  96.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  25.34 
 
 		 1082 aa  96.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.62 
 
 		 486 aa  95.9  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  30.08 
 
 		 404 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 775 aa  95.5  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  28.46 
 
 		 754 aa  94.7  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  28.53 
 
 		 438 aa  94.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  27.17 
 
 		 566 aa  94.4  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  29.52 
 
 		 396 aa  94.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  25.69 
 
 		 559 aa  93.6  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 		 519 aa  93.2  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  31.3 
 
 		 708 aa  93.2  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  31.94 
 
 		 443 aa  92.8  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.46 
 
 		 606 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.71 
 
 		 1480 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  30.92 
 
 		 671 aa  92.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  31.87 
 
 		 467 aa  91.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.69 
 
 		 388 aa  91.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.4 
 
 		 678 aa  91.7  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>