More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  98.34 
 
 		 663 aa  1313    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1340    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2356  protein serine/threonine phosphatase  41.16 
 
 		 679 aa  519  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  36.52 
 
 		 661 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2114  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 		 666 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1487  diguanylate cyclase  31.99 
 
 		 587 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0988426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4266  protein serine/threonine phosphatase  38.04 
 
 		 614 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1841  stage II sporulation E family protein  37.2 
 
 		 616 aa  207  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4125  diguanylate cyclase  32.58 
 
 		 592 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3791  diguanylate cyclase  30.6 
 
 		 572 aa  205  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2273  diguanylate cyclase  35.38 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0206  diguanylate cyclase  29.58 
 
 		 556 aa  183  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0661328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3047  serine phosphatase  32.47 
 
 		 397 aa  180  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3040  protein serine/threonine phosphatase  37.16 
 
 		 410 aa  174  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298703  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1432  protein serine/threonine phosphatase  33.46 
 
 		 403 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2929  serine phosphatase  37.64 
 
 		 410 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237417  normal  0.195412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1786  protein serine/threonine phosphatase  34.81 
 
 		 557 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5579  protein serine/threonine phosphatase  38.72 
 
 		 413 aa  165  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2259  serine phosphatase  37.12 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  31.96 
 
 		 556 aa  159  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1473  protein serine/threonine phosphatase  31.71 
 
 		 558 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3326  protein serine/threonine phosphatase  34.75 
 
 		 414 aa  151  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0984  protein serine/threonine phosphatase  34.75 
 
 		 414 aa  150  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4586  protein serine/threonine phosphatase  35.18 
 
 		 604 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3125  protein serine/threonine phosphatase  32.05 
 
 		 411 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1587  protein serine/threonine phosphatase  32.51 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.661001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2934  protein serine/threonine phosphatase  32.05 
 
 		 410 aa  120  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  26.21 
 
 		 706 aa  104  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  26.89 
 
 		 786 aa  102  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  27.35 
 
 		 708 aa  100  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  26.23 
 
 		 705 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  26.7 
 
 		 785 aa  97.8  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  26.69 
 
 		 643 aa  97.1  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  26.22 
 
 		 786 aa  95.5  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  30.65 
 
 		 543 aa  94  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  27.63 
 
 		 723 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  26.68 
 
 		 645 aa  88.6  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  26.5 
 
 		 649 aa  87.4  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  23.96 
 
 		 645 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  23.77 
 
 		 648 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  26.33 
 
 		 660 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  23.91 
 
 		 644 aa  80.5  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  25.81 
 
 		 643 aa  80.5  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  25.36 
 
 		 705 aa  79.7  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  27.04 
 
 		 716 aa  79  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.93 
 
 		 640 aa  77  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  24.44 
 
 		 705 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.37 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.05 
 
 		 645 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.05 
 
 		 645 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  26.95 
 
 		 657 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 699 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0171  putative PAS/PAC sensor protein  26.18 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.91 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.81 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  22.19 
 
 		 682 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 792 aa  73.9  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  30.22 
 
 		 633 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  25.36 
 
 		 678 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  29.38 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  23.9 
 
 		 642 aa  70.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  26.38 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.4 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  23.75 
 
 		 559 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  27.33 
 
 		 683 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  23.94 
 
 		 687 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3308  diguanylate cyclase  24.82 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  34.85 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  29.51 
 
 		 733 aa  67  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.85 
 
 		 645 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  29.37 
 
 		 649 aa  66.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  19.71 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  24.3 
 
 		 967 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  24.3 
 
 		 967 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  24.8 
 
 		 663 aa  65.1  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.04 
 
 		 643 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  28.02 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  22.18 
 
 		 817 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  22.18 
 
 		 817 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  26.73 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  25.6 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2449  GGDEF domain-containing protein  23.91 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  30.5 
 
 		 846 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  26.22 
 
 		 715 aa  63.9  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  27.94 
 
 		 637 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.59 
 
 		 1480 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.4 
 
 		 684 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.05 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  25.36 
 
 		 910 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4260  sensor histidine kinase/response regulator  28.36 
 
 		 669 aa  62  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  24.91 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  21.39 
 
 		 373 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  40.66 
 
 		 421 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.17 
 
 		 563 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  24.21 
 
 		 536 aa  61.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  26.01 
 
 		 1023 aa  60.8  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  35 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  24.8 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.99 
 
 		 590 aa  60.8  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  25.09 
 
 		 840 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>