More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1472 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  100 
 
 		 404 aa  826    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  52.6 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  45.06 
 
 		 396 aa  342  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  29.54 
 
 		 637 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  30.28 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.13 
 
 		 590 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  32.24 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  28.97 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.25 
 
 		 384 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  31.25 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  33.2 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  28.93 
 
 		 536 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.87 
 
 		 480 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.87 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  28.92 
 
 		 706 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.18 
 
 		 393 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.18 
 
 		 393 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  29.28 
 
 		 705 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  27.94 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.39 
 
 		 1332 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  29.37 
 
 		 708 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  30.3 
 
 		 663 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.96 
 
 		 961 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  27.24 
 
 		 1079 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  31.62 
 
 		 846 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  27.63 
 
 		 1087 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5042  protein serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 		 502 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  25.18 
 
 		 775 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  30.68 
 
 		 521 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  27.24 
 
 		 1087 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  28.12 
 
 		 754 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  29.2 
 
 		 438 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.88 
 
 		 507 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  27.05 
 
 		 1100 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  29.06 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  27.11 
 
 		 840 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  29.17 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.6 
 
 		 579 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.76 
 
 		 957 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.13 
 
 		 572 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  25.48 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  29.44 
 
 		 853 aa  106  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  26.83 
 
 		 817 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  26.83 
 
 		 817 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  30.6 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  28.68 
 
 		 521 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  30.13 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  27.37 
 
 		 631 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3351  stage II sporulation E family protein  28.57 
 
 		 278 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0984  protein serine/threonine phosphatase  22.73 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  28.28 
 
 		 715 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  26.48 
 
 		 451 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.4 
 
 		 486 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  28.14 
 
 		 1083 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  27.35 
 
 		 464 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  29.84 
 
 		 683 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  30.5 
 
 		 687 aa  103  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3326  protein serine/threonine phosphatase  22.73 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  26.91 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  27.97 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 		 967 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 		 967 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 		 649 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.27 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  28.1 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.74 
 
 		 684 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  29.61 
 
 		 642 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  28.46 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.07 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 		 781 aa  101  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  27.27 
 
 		 649 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.93 
 
 		 549 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  29.61 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  26.96 
 
 		 705 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  28.93 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  27.18 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  26.69 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  29.32 
 
 		 885 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.36 
 
 		 678 aa  99.8  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  27.72 
 
 		 642 aa  99.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 		 667 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3040  protein serine/threonine phosphatase  23.8 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298703  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  27.03 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  28.85 
 
 		 262 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  28.22 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  30.35 
 
 		 786 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  29.03 
 
 		 634 aa  99  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.06 
 
 		 748 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 		 670 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0672  RsbU-like serine phosphatase, regulator of sigma subunit  28.34 
 
 		 254 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  26.83 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  26.51 
 
 		 682 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  27.14 
 
 		 379 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  27.56 
 
 		 716 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6569  protein serine/threonine phosphatase  27.24 
 
 		 556 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  30.24 
 
 		 455 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2571  protein serine/threonine phosphatase  25.69 
 
 		 251 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  28.11 
 
 		 683 aa  97.1  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2259  serine phosphatase  22.91 
 
 		 415 aa  96.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.299146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>