More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0599 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  100 
 
 		 516 aa  1066    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.29 
 
 		 522 aa  647    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  82.2 
 
 		 541 aa  855    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.04 
 
 		 542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  54.73 
 
 		 542 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 		 540 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 544 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  40.31 
 
 		 584 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  40.67 
 
 		 560 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 586 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 584 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 570 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  38.66 
 
 		 548 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 548 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 548 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  32.15 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 494 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 491 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 662 aa  229  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 691 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  40.13 
 
 		 655 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  31.34 
 
 		 499 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.12 
 
 		 819 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  33.92 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  39.13 
 
 		 673 aa  220  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 671 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 656 aa  217  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 819 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  37.69 
 
 		 656 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 487 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  36.72 
 
 		 672 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 672 aa  213  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 661 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 655 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  36.88 
 
 		 661 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 655 aa  210  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  37.89 
 
 		 674 aa  209  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 804 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 488 aa  209  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  36.25 
 
 		 647 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 592 aa  206  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  32.69 
 
 		 490 aa  206  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 498 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  39.41 
 
 		 592 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 630 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.42 
 
 		 1255 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 		 801 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 654 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 613 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  36.91 
 
 		 600 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 646 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 495 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 528 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.828791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  43.37 
 
 		 420 aa  195  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  44.05 
 
 		 1092 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  38.96 
 
 		 646 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  43.19 
 
 		 1062 aa  194  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 680 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  41.04 
 
 		 708 aa  190  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 557 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  37.22 
 
 		 663 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  36.71 
 
 		 676 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  36.22 
 
 		 667 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 658 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  42.96 
 
 		 626 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 713 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 707 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 717 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  37.96 
 
 		 717 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 717 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 709 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 676 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 717 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  36.7 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 711 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  41.1 
 
 		 1258 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  32.95 
 
 		 711 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 852 aa  183  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.82 
 
 		 952 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  41.74 
 
 		 1061 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2042  sensor histidine kinase  32.49 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 709 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 594 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 		 1465 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 1021 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  35.4 
 
 		 706 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 402 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 656 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 645 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 611 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 611 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  34.93 
 
 		 483 aa  179  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 589 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2189  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 726 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 705 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  39.29 
 
 		 611 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>