More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1551 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  100 
 
 		 661 aa  1350    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2114  protein serine/threonine phosphatase  47.01 
 
 		 666 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  36.84 
 
 		 663 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  36.52 
 
 		 663 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2356  protein serine/threonine phosphatase  31.03 
 
 		 679 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4266  protein serine/threonine phosphatase  28.89 
 
 		 614 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1841  stage II sporulation E family protein  27.38 
 
 		 616 aa  241  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1487  diguanylate cyclase  31.55 
 
 		 587 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0988426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4125  diguanylate cyclase  31.87 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3791  diguanylate cyclase  29.56 
 
 		 572 aa  206  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3047  serine phosphatase  33.07 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2273  diguanylate cyclase  29.31 
 
 		 563 aa  183  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  33.51 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1473  protein serine/threonine phosphatase  38.83 
 
 		 558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3040  protein serine/threonine phosphatase  39.15 
 
 		 410 aa  161  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298703  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1786  protein serine/threonine phosphatase  34.82 
 
 		 557 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2929  serine phosphatase  37.31 
 
 		 410 aa  157  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237417  normal  0.195412 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1432  protein serine/threonine phosphatase  31.34 
 
 		 403 aa  157  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3326  protein serine/threonine phosphatase  33.21 
 
 		 414 aa  154  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0206  diguanylate cyclase  25.12 
 
 		 556 aa  153  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0661328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0984  protein serine/threonine phosphatase  32.47 
 
 		 414 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2259  serine phosphatase  33.46 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4586  protein serine/threonine phosphatase  36.44 
 
 		 604 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5579  protein serine/threonine phosphatase  35.23 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3125  protein serine/threonine phosphatase  32.31 
 
 		 411 aa  139  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1587  protein serine/threonine phosphatase  31.53 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.661001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2934  protein serine/threonine phosphatase  30.38 
 
 		 410 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  27.92 
 
 		 705 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  27.27 
 
 		 785 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  27.06 
 
 		 786 aa  97.8  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  27.64 
 
 		 786 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  25.34 
 
 		 706 aa  94.4  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  24.39 
 
 		 648 aa  92.8  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  28.37 
 
 		 644 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  26.47 
 
 		 645 aa  91.3  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  26.87 
 
 		 705 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  24.56 
 
 		 559 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  24.6 
 
 		 705 aa  85.1  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  28.07 
 
 		 817 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  28.07 
 
 		 817 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  28.22 
 
 		 682 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  29.09 
 
 		 630 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  29.09 
 
 		 630 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  29.09 
 
 		 630 aa  84  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  27.05 
 
 		 649 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  28.13 
 
 		 543 aa  83.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  27.46 
 
 		 633 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  27.38 
 
 		 657 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  27.8 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  25.99 
 
 		 642 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  26.79 
 
 		 643 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3723  HAMP domain-containing protein  27.63 
 
 		 628 aa  78.2  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  26.83 
 
 		 710 aa  77.8  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  30.71 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  24.45 
 
 		 678 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  20.8 
 
 		 708 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  27.61 
 
 		 634 aa  76.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.93 
 
 		 1240 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3308  diguanylate cyclase  25.08 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.06 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.29 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  25.8 
 
 		 670 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  25.8 
 
 		 667 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  28.01 
 
 		 967 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  28.01 
 
 		 967 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  31.1 
 
 		 846 aa  70.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.22 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  24.36 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  24.64 
 
 		 373 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  24.59 
 
 		 885 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  23.48 
 
 		 362 aa  70.1  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.57 
 
 		 1480 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  25.71 
 
 		 716 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  23.57 
 
 		 378 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  23.25 
 
 		 660 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.63 
 
 		 957 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  26.79 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28 
 
 		 961 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.92 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  26.69 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  25.65 
 
 		 683 aa  67.4  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.12 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  23.33 
 
 		 687 aa  67  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 699 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  24.83 
 
 		 445 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  27.09 
 
 		 395 aa  66.6  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  30.98 
 
 		 451 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0346  protein serine/threonine phosphatase  26.4 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.21 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  24.29 
 
 		 723 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  26.71 
 
 		 840 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  32.65 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  26.27 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  32.48 
 
 		 391 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  28.91 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.7 
 
 		 627 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  27.35 
 
 		 1268 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.84 
 
 		 528 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 383 aa  62  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0171  putative PAS/PAC sensor protein  23.94 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>