More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1005 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 667 aa  1357    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  99.55 
 
 		 670 aa  1329    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  64.65 
 
 		 967 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  64.65 
 
 		 967 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  58.3 
 
 		 817 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  58.3 
 
 		 817 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  66.07 
 
 		 705 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  65.17 
 
 		 682 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2571  protein serine/threonine phosphatase  69.96 
 
 		 251 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  61.02 
 
 		 393 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  61.02 
 
 		 393 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  56.47 
 
 		 840 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  58.27 
 
 		 378 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  45.21 
 
 		 663 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  45.78 
 
 		 786 aa  278  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  51.53 
 
 		 521 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  46.43 
 
 		 785 aa  270  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  45.36 
 
 		 786 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  28.18 
 
 		 649 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 		 642 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  29.2 
 
 		 642 aa  170  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 		 1480 aa  166  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  28.21 
 
 		 637 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  26.82 
 
 		 637 aa  162  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  50.37 
 
 		 591 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.05 
 
 		 1468 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0696  sensory box/GGDEF family protein  54.92 
 
 		 568 aa  154  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.612215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0539  sensory box, GGDEF family protein  54.92 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0539  sensory box, GGDEF family protein  54.92 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0683  sensory box/GGDEF family protein  54.92 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00619208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0664  sensory box/GGDEF family protein  54.92 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0541  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.1 
 
 		 567 aa  153  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4673  sensory box/GGDEF family protein  54.1 
 
 		 567 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.6834899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0757  sensory box/GGDEF family protein  54.1 
 
 		 567 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 		 916 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0595  sensory box/GGDEF family protein  54.1 
 
 		 567 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0628  sensory box/GGDEF family protein  54.1 
 
 		 567 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 1202 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 430 aa  148  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 1033 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 1207 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1083  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  51.67 
 
 		 812 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 		 1303 aa  140  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.04 
 
 		 1245 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1114  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.12 
 
 		 722 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 763 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 618 aa  135  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.93 
 
 		 1177 aa  133  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 791 aa  130  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1041 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0211  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.01 
 
 		 1076 aa  128  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  25.46 
 
 		 853 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.33 
 
 		 568 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1046  putative PAS/PAC sensor protein  32.78 
 
 		 530 aa  126  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  29.97 
 
 		 543 aa  125  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1660  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.73 
 
 		 997 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.933156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  27.14 
 
 		 684 aa  122  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1101 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  29 
 
 		 630 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 		 901 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  29.3 
 
 		 630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1889  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.84 
 
 		 562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.969395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  29.3 
 
 		 630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 1560 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2258  sensory box protein  39.02 
 
 		 562 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202787  normal  0.0243284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3480  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.02 
 
 		 562 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629722  normal  0.285223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  29.6 
 
 		 451 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1118 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4387  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.97 
 
 		 718 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4925  sensory box sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 614 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1229 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.62 
 
 		 572 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  25.9 
 
 		 754 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.58 
 
 		 989 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1984  PAS sensor protein  29.07 
 
 		 506 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.117644  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 1568 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2771  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.13 
 
 		 860 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  29.45 
 
 		 366 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2926  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.34 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000284142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  26.69 
 
 		 381 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.24 
 
 		 957 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0601  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.03 
 
 		 489 aa  106  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  28.82 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  32.4 
 
 		 687 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 926 aa  105  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  30.23 
 
 		 633 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.62 
 
 		 413 aa  104  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  26.96 
 
 		 1100 aa  104  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  28.43 
 
 		 453 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  29.25 
 
 		 649 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  30.42 
 
 		 631 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 681 aa  103  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 1313 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.7 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.63 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.94 
 
 		 961 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.14 
 
 		 1332 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2193  diguanylate cyclase  29.06 
 
 		 1196 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.59 
 
 		 894 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>